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超20萬個(gè)計(jì)算模型 打造全球最大數(shù)字微生物寶庫(kù)!
2025年02月19日 10:47:38 來源:化工儀器網(wǎng) 點(diǎn)擊量:4397

全球最大的數(shù)字微生物庫(kù)——“阿波羅”包含了247092個(gè)計(jì)算模型,其中包括迄今為止最為完整的人體微生物組計(jì)算模型。

  來自愛爾蘭、法國(guó)和意大利的科研人員合作,共同創(chuàng)建了全球規(guī)模最大的數(shù)字微生物數(shù)據(jù)庫(kù)——“阿波羅”(APOLLO)。該數(shù)據(jù)庫(kù)包含了247092個(gè)計(jì)算模型,其中包括迄今為止最為完整的人體微生物組計(jì)算模型。
 
  研究團(tuán)隊(duì)主要關(guān)注了細(xì)菌微生物組,即存在于人體內(nèi)外的細(xì)菌群落。他們根據(jù)實(shí)際樣本,構(gòu)建了14451個(gè)微生物群落的計(jì)算模型,每個(gè)模型都展示了這些群落內(nèi)不同微生物的代謝過程如何因身體部位、年齡和健康狀況的不同而發(fā)生變化。
 
  這些計(jì)算模型涵蓋了身體的不同部位,跨越了不同的年齡段,是迄今為止最為全面的人類微生物組計(jì)算模型集合。“阿波羅”項(xiàng)目還預(yù)測(cè)了與克羅恩病、帕金森病和兒童營(yíng)養(yǎng)不良相關(guān)的關(guān)鍵代謝物,為開發(fā)新的診斷和治療方法提供了寶貴的線索。
 
  研究團(tuán)隊(duì)表示,這一數(shù)據(jù)庫(kù)將成為科學(xué)家探索微生物在人體內(nèi)功能、微生物與健康和疾病相互作用的新利器,降低對(duì)繁瑣的活體生物實(shí)驗(yàn)的依賴。
 
  這一成就源自團(tuán)隊(duì)長(zhǎng)達(dá)十年的專業(yè)積累,從最初涉及數(shù)百種微生物的“腸道微生物代謝重建與分析”(AGORA)項(xiàng)目,到后續(xù)擴(kuò)展至數(shù)千種微生物的AGORA2,直至今日的“阿波羅”項(xiàng)目。
 
  研究團(tuán)隊(duì)指出,借助“阿波羅”系統(tǒng),科學(xué)家能夠通過識(shí)別微生物代謝標(biāo)志物來開發(fā)非侵入性的診斷工具,從而實(shí)現(xiàn)更早且更準(zhǔn)確的疾病診斷。這些模擬實(shí)驗(yàn)不僅能預(yù)測(cè)個(gè)體的微生物組與飲食、藥物和健康狀況之間的相互作用,還能為精準(zhǔn)醫(yī)療提供依據(jù),例如定制化的益生菌、益生元以及基于微生物組的個(gè)性化療法。這將有助于每個(gè)人更好地管理腸道健康,并針對(duì)特定疾病進(jìn)行更有效的治療。
 
  此項(xiàng)技術(shù)進(jìn)步無疑為醫(yī)學(xué)領(lǐng)域帶來了新的希望,尤其是對(duì)于那些依賴于早期診斷和個(gè)性化治療方案的慢性疾病患者而言。同時(shí),這也提示我們未來醫(yī)療的發(fā)展方向可能更加注重個(gè)體化和精準(zhǔn)化,以期達(dá)到更好的治療效果。相關(guān)論文發(fā)表于最新一期《細(xì)胞系統(tǒng)》雜志。
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