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大連化物所提出蛋白質(zhì)相互作用識別和干預(yù)機(jī)制分析新方法
2021年01月14日 16:57:24 來源:大連化學(xué)物理研究所 點(diǎn)擊量:5406

近日,中國科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所研究員王方軍團(tuán)隊(duì)在蛋白質(zhì)復(fù)合物形成和干預(yù)機(jī)制分析新方法研究方面取得進(jìn)展,通過溶液狀態(tài)蛋白質(zhì)賴氨酸兩步穩(wěn)定同位素標(biāo)記和定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析,實(shí)現(xiàn)對蛋白—蛋白識別關(guān)鍵位點(diǎn)區(qū)域的探測,并可評估小分子對蛋白質(zhì)復(fù)合物的構(gòu)象識別干預(yù)情況。

化工儀器網(wǎng) 科技前沿】近日,中國科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所研究員王方軍團(tuán)隊(duì)在蛋白質(zhì)復(fù)合物形成和干預(yù)機(jī)制分析新方法研究方面取得進(jìn)展,通過溶液狀態(tài)蛋白質(zhì)賴氨酸兩步穩(wěn)定同位素標(biāo)記和定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析,實(shí)現(xiàn)對蛋白—蛋白識別關(guān)鍵位點(diǎn)區(qū)域的探測,并可評估小分子對蛋白質(zhì)復(fù)合物的構(gòu)象識別干預(yù)情況。
 
  蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和相互作用決定了其生物學(xué)功能,目前對溶液狀態(tài)蛋白—蛋白識別和結(jié)構(gòu)動態(tài)變化研究仍然缺乏高靈敏度的分析方法。此前,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)上賴氨酸的原位標(biāo)記反應(yīng)性與其所處微觀結(jié)構(gòu)中的氫鍵、靜電相互作用強(qiáng)度密切相關(guān);提出以蛋白質(zhì)上所有賴氨酸位點(diǎn)為內(nèi)源性反應(yīng)探針,通過定量賴氨酸在蛋白—蛋白,蛋白—小分子結(jié)合前后的標(biāo)記反應(yīng)性變化,探測蛋白質(zhì)識別過程中的關(guān)鍵區(qū)域。
 
  為進(jìn)一步提高賴氨酸反應(yīng)性定量分析的通量和靈敏度,該團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步發(fā)展了溶液狀態(tài)蛋白質(zhì)“活性—變性”賴氨酸兩步穩(wěn)定同位素標(biāo)記定量策略(TILLRP),系統(tǒng)研究了重組SARS-CoV-2 S1蛋白質(zhì)和人體ACE2受體之間的相互作用情況;發(fā)現(xiàn)S1蛋白質(zhì)RBD Lys386-Lys462區(qū)域的賴氨酸位點(diǎn)在S1-ACE2復(fù)合物形成前后標(biāo)記反應(yīng)性發(fā)生了顯著改變;提出可以利用該區(qū)域賴氨酸的標(biāo)記反應(yīng)性調(diào)控水平評估小分子活性物質(zhì)對S1-ACE2識別的干預(yù)情況,可能有助于相關(guān)治療藥物分子的研發(fā)。
 
  該研究結(jié)果發(fā)表在《化學(xué)科學(xué)》(Chemical Science)上。上述研究工作得到國家自然科學(xué)基金、大連化物所創(chuàng)新基金等項(xiàng)目的資助。
 
大連化物所提出蛋白質(zhì)相互作用識別和干預(yù)機(jī)制分析新方法
 
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