靶向蛋白質(zhì)組學(xué)概述：技術(shù)、關(guān)鍵點(diǎn)及應(yīng)用

靶向蛋白質(zhì)組學(xué)概述：技術(shù)、關(guān)鍵點(diǎn)及應(yīng)用檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在生命科學(xué)研究不斷向jīngzhǔn化、量化與臨床轉(zhuǎn)化推進(jìn)的jīntiān，靶向蛋白質(zhì)組學(xué)（Targeted Proteomics）以其高靈敏、高特異性與高重復(fù)性的特征，已成為蛋白質(zhì)組學(xué)走向臨床的重要工具。它是連接“組學(xué)發(fā)現(xiàn)”與“實(shí)際應(yīng)用”的關(guān)鍵橋梁，特別適用于疾病標(biāo)志物驗(yàn)證、藥效學(xué)研究、免疫監(jiān)測和質(zhì)量控制等領(lǐng)域。

一、什么是靶向蛋白質(zhì)組學(xué)？

靶向蛋白質(zhì)組學(xué)以質(zhì)譜為核心檢測手段，其共同特征是對目標(biāo)肽段進(jìn)行事先選擇、再進(jìn)行特異性采集與定量。當(dāng)前常用的三種策略包括：

1、MRM/SRM（Multiple/Selected Reaction Monitoring）：基于三重四極桿質(zhì)譜，監(jiān)測設(shè)定的前體-產(chǎn)物離子對，廣泛用于高通量、多樣本驗(yàn)證；

2、PRM（Parallel Reaction Monitoring）：基于高分辨率質(zhì)譜（如Orbitrap），對目標(biāo)前體離子所有碎片進(jìn)行并行掃描，提高特異性與數(shù)據(jù)再利用能力；

3、SWATH-MS（Sequential Window Acquisition of All Theoretical Fragment Ions）：一種數(shù)據(jù)非依賴采集（DIA）策略，通過滑動窗口采集全范圍碎片信息，后期可實(shí)現(xiàn)類靶向定量分析。

值得注意的是，SWATH技術(shù)雖然具備靶向分析能力，但其本質(zhì)屬于DIA技術(shù)范疇，實(shí)際應(yīng)用中常用于靶標(biāo)初篩與中通量定量。

二、靶向蛋白質(zhì)組學(xué)的技術(shù)關(guān)鍵點(diǎn)

1、肽段選擇策略

• wéiyī性（只來自目標(biāo)蛋白）

• 良好的離子化效率

• 穩(wěn)定、不含修飾或易降解位點(diǎn)

2、內(nèi)標(biāo)引入與定量方法

• 相對定量：基于肽段峰面積比較

• juéduì定量：加入穩(wěn)定同位素標(biāo)記肽（SIS）校正系統(tǒng)誤差

3、標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)驗(yàn)流程

• 樣本處理（提取、酶解、凈化）

• 儀器參數(shù)優(yōu)化（碰撞能、保留時(shí)間窗口）

• 軟件分析（Skyline、Spectronaut 等）

三、靶向蛋白質(zhì)組學(xué)的優(yōu)勢與局限

1、優(yōu)勢

2、局限性

* 需要先驗(yàn)信息，無法用于未知蛋白發(fā)現(xiàn)

• 方法開發(fā)仍需優(yōu)化過程，尤其MRM的轉(zhuǎn)移選擇

四、靶向蛋白質(zhì)組學(xué)的典型應(yīng)用場景

1、疾病生物標(biāo)志物驗(yàn)證

• 癌癥早篩：如乳腺癌中PRM驗(yàn)證候選蛋白

• 自身免疫病標(biāo)志物評估

• 心血管病高風(fēng)險(xiǎn)人群分型

2、藥物靶點(diǎn)與療效評估

• 監(jiān)測藥物對信號通路關(guān)鍵蛋白的表達(dá)調(diào)控

• 多時(shí)間點(diǎn)PRM監(jiān)控治療動態(tài)變化

3、液體活檢與復(fù)雜樣本分析

• 靶向蛋白組學(xué)適合血漿、尿液、腦脊液等

• 可識別極低豐度的腫瘤來源蛋白

4、合成生物與細(xì)胞工廠監(jiān)測

• jīngzhǔn定量代謝通路關(guān)鍵酶

• 輔助微生物蛋白表達(dá)調(diào)控與優(yōu)化

五、百泰派克生物科技的靶向蛋白組服務(wù)特色

百泰派克生物科技構(gòu)建了涵蓋 MRM、PRM 及 DIA/SWATH 技術(shù)的完整服務(wù)平臺，滿足科研及轉(zhuǎn)化研究的多樣化需求：

• 多平臺支持：Agilent 6495、SCIEX QTRAP 三重四極桿平臺；Orbitrap Exploris 高分辨PRM平臺；支持SWATH數(shù)據(jù)采集與譜庫構(gòu)建；

• 方法開發(fā)靈活：提供靶點(diǎn)篩選、SIS肽設(shè)計(jì)與定制等個(gè)性化服務(wù)；

• 標(biāo)準(zhǔn)化流程控制：從樣本處理到數(shù)據(jù)分析全流程質(zhì)量管理；

• 支持DIA與靶向聯(lián)合分析：助力候選蛋白從發(fā)現(xiàn)到驗(yàn)證的閉環(huán)研究。

靶向蛋白質(zhì)組學(xué)作為蛋白定量分析的重要工具，正在成為連接基礎(chǔ)研究與轉(zhuǎn)化應(yīng)用的橋梁。通過合理選擇MRM、PRM或SWATH策略，科研人員可根據(jù)研究目標(biāo)實(shí)現(xiàn)對關(guān)鍵蛋白的靈敏、穩(wěn)定、可重復(fù)的定量檢測。百泰派克生物科技致力于為研究者提供高質(zhì)量、高可信度的靶向蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)，推動疾病機(jī)制研究、生物標(biāo)志物驗(yàn)證與生物藥研發(fā)的深入發(fā)展。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對蛋白質(zhì)的氨基酸組成分析，N端測序，C端測序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質(zhì)N端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的蛋白質(zhì)，提供基于從頭測序法的蛋白質(zhì)從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上先進(jìn)的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白質(zhì)組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白質(zhì)組學(xué)、靶向蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種蛋白質(zhì)標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)先進(jìn)，填補(bǔ)技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從蛋白質(zhì)、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

靶向蛋白質(zhì)組學(xué)概述：技術(shù)、關(guān)鍵點(diǎn)及應(yīng)用檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹