抗原決定簇大多存在于抗原物質(zhì)的表面，有些存在于抗原物質(zhì)的內(nèi)部，須經(jīng)酶或其他方式處理后才暴露出來。一個天然抗原物質(zhì)可有多種和多個決定簇?？乖肿釉酱?，決定簇的數(shù)目越多。在各個抗原決定簇中，zui易引起免疫應答的是免疫原性決定簇。決定簇可進一步細分為兩類：

①抗原決定簇。作用在B細胞上，并可與對應體的Fab段結(jié)合。ELISA試劑盒

②免疫原性決定簇。zui后作用在T細胞上，與細胞免疫有關(guān)。

抗原分子的B細胞決定簇大小不同，其zui大表面積約為50～70mm,約由4～6氨基酸殘基或糖基組成。100個氨基酸殘基多肽可有14到20個非重疊決定簇，由線狀排列彼此相鄰的氨基酸組成，故稱為線性或連續(xù)性決定簇。而球蛋白是有三維空間的折疊肽鏈，故其大多數(shù)決定簇被掩蓋在內(nèi)部，可稱為隱蔽性決定簇。只存在于其表面的決定簇可被免疫細胞識別，或與抗體結(jié)合者稱為功能性決定簇。組成這種決定簇的氨基酸，是由折疊的肽鏈將有同位置的氨基酸使之相鄰成為有一定空間構(gòu)型的決定簇，故稱為構(gòu)像決定簇或不連續(xù)決定簇。現(xiàn)已證明抗原分子的抗原性是由其組成的氨基酸序列、空間構(gòu)型及其決定簇片段的移動決定的。

T細胞決定簇為免疫原性多肽片段，屬連續(xù)性決定簇。但它不存在天然蛋白分子表面，必須經(jīng)抗原呈遞細胞加工處理為小肽分子，然后再與自己MHC分子結(jié)合才能被T細胞所識別。而B細胞決定簇可存在于天然抗原分子表面，不須經(jīng)加工處理，即可直接被B細胞所識別。

在天然大分子蛋白質(zhì)抗原直接證明其存在有T細胞決定簇和B細胞決定簇是十分困難的。但用小分子已知結(jié)構(gòu)的免疫原進行研究已證明其存有2種決定簇。胰腺高血糖素激素（glucagon）由29個氨基酸組成，有免疫原性。由其產(chǎn)生的抗激素抗體可識別其氨基末端。由其產(chǎn)生的殺傷T細胞可識別其羧基末端，相當于激素分子的載體部分。由此證明胰高血糖素分子的氨基端為B細胞決定簇，而羥基端為T細胞決定簇ELISA試劑盒

抗原物質(zhì)的這兩種決定簇的部位決定著體液免疫和細胞免疫的特異性 。蛋白質(zhì)抗原決定簇的大小一般不超過6～8個氨基酸殘基 ；碳水化合物抗原決定簇約含6 個單位的己糖(六碳糖)；核酸半抗原的每個抗原決定簇約含6～8個核苷酸?？乖瓫Q定簇的特異性不僅依賴其氨基酸組成、數(shù)目和排列順序，也依賴于分子局部構(gòu)型以及分子的其余部分對此局部構(gòu)型的影響。