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近日,上海市為促進(jìn)創(chuàng)新產(chǎn)品的市場(chǎng)化、產(chǎn)業(yè)化,強(qiáng)化產(chǎn)業(yè)功能,推動(dòng)研發(fā)活動(dòng)產(chǎn)業(yè)化,全力打響“上海制造"品牌,支撐上海產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展,發(fā)起了2023年度《上海市創(chuàng)新產(chǎn)品推薦目錄》編制申報(bào)工作,翌圣生物CUT&Tag試劑盒有幸入選。
圖:《2023年度上海市創(chuàng)新產(chǎn)品推薦目錄》公示截圖
圖:CUT&Tag實(shí)驗(yàn)流程圖
在CUT&Tag試劑盒轉(zhuǎn)化過(guò)程中,翌圣生物開(kāi)創(chuàng)性的在試劑盒中引入spike in,該技術(shù)已申請(qǐng)相關(guān)。
圖:翌圣生物CUT&Tag技術(shù)申請(qǐng)
在CUT&Tag技術(shù)上,翌圣不斷突破創(chuàng)新,2023年4月,翌圣推出Multi-CUT&Tag試劑盒,實(shí)現(xiàn)一份細(xì)胞,兩個(gè)靶標(biāo)的研究。在節(jié)省樣本的同時(shí),也節(jié)省時(shí)間和試劑。
圖:Multi-CUT&Tag實(shí)驗(yàn)流程
大豆與根瘤菌共生形成高效共生固氮體——根瘤,為大豆生長(zhǎng)發(fā)育及籽粒蛋白含量提供約65%得氮素來(lái)源,但是根瘤衰老會(huì)影響固氮終止從而影響大豆的生長(zhǎng)發(fā)育,目前,根瘤衰老機(jī)制尚未被解析。作者利用CUT&Tag技術(shù)結(jié)合RNA-seq解析了根瘤衰老調(diào)控機(jī)制,建立了NAC-CYP分子模塊調(diào)控大豆根瘤衰老的模型也為大豆氮素高效吸收提供關(guān)鍵理論依據(jù)。
圖:CUT&Tag-qPCR驗(yàn)證大豆根瘤中,NAC039直接靶向半胱氨酸蛋白酶(CYP)基因
(XX. Yu et al. Plant Cell. 2023)
環(huán)狀RNA(circRNA)是RNA大分子的一個(gè)亞類,據(jù)報(bào)道參與骨骼肌發(fā)育的調(diào)節(jié)。然而,circRNA在雞肌肉發(fā)生中的功能和調(diào)節(jié)機(jī)制仍不清楚。作者鑒定了一種新的circRNA靶標(biāo)分子circGPD2,并通過(guò)各種濕實(shí)驗(yàn)和CUT&Tag實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證circGPD2對(duì)成肌細(xì)胞的增殖和分化具有積極作用:circGPD2通過(guò)解除miR-203a對(duì)c-JUN和MEF2C抑制作用來(lái)發(fā)揮功能,此外,生肌調(diào)節(jié)因子MyoG通過(guò)靶向GPD2啟動(dòng)子上的E-box元件增強(qiáng)circGPD2的表達(dá)。
圖:CUT&Tag-qPCR結(jié)果表明在雞成肌細(xì)胞中,MyoG可以與P4啟動(dòng)子區(qū)域的E-box 1結(jié)合
(X. Shen et al. Int J Biol Macromol.2022)
CUT&Tag技術(shù)在小鼠胚胎干細(xì)胞中的應(yīng)用
通過(guò)DNA-蛋白互作、RNA-DNA互作、RNA-蛋白質(zhì)互作等技術(shù),探索發(fā)育信號(hào)傳導(dǎo)中的調(diào)控機(jī)制:Nodal 誘導(dǎo)的 lncRNA-Smad7 通過(guò)抑制小鼠胚胎干細(xì)胞 (mESC) 中的 BMP 信號(hào)傳導(dǎo)來(lái)調(diào)節(jié)細(xì)胞命運(yùn)決定,lncRNA-Smad7 拮抗 mESC 中的 BMP 信號(hào)傳導(dǎo),并類似地調(diào)節(jié) C2C12 小鼠成肌細(xì)胞中骨細(xì)胞和肌細(xì)胞形成之間的細(xì)胞命運(yùn)決定。此外,lncRNA-Smad7 與 mESC 中的 hnRNPK 結(jié)合,并且 hnRNPK 與 Bmp2 啟動(dòng)子結(jié)合,可能有助于 Bmp2 表達(dá)抑制。
圖:CUT&Tag結(jié)果顯示LncRNA-Smad7 KD導(dǎo)致Bmp2啟動(dòng)子區(qū)域的H3K27me3修飾減少,而LncRNA-Smad7與hnRNPK相互作用。
(XH. Kong et al. Nucleic Acids Res. 2022)
CUT&Tag技術(shù)在癌癥免疫調(diào)控中的應(yīng)用
圖:FBXO42敲除后的細(xì)胞中的染色質(zhì)免疫調(diào)控圖譜
(H. Jiang et al. Sci Adv. 2022)
CUT&Tag技術(shù)在生殖細(xì)胞中的應(yīng)用
圖:CUT&Tag技術(shù)表明znhit1依賴的H2A.Z摻入與轉(zhuǎn)錄激活因子Stra8共定位
(Sun et al. Developmental Cell. 2022)
產(chǎn)品名稱 | 貨號(hào) | 規(guī)格 |
Hieff NGS® G-Type In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina®CUT&Tag建庫(kù)試劑盒 | 12598ES12/48 | 12 T/ 48 T |
Hieff NGS® Multi-CUT&Tag Library Prep Kit for Illumina®多靶標(biāo)CUT&Tag試劑盒 | 12592ES24/96 | 12 T/ 48 T |
1、Plant Cell | CUT&Tag聯(lián)合RNA-seq測(cè)序,解析大豆根瘤衰老的調(diào)控機(jī)制
2、Multi-CUT&Tag技術(shù)原理解析
3、跟著寶典走,三天成高手!《CUT&Tag進(jìn)階手冊(cè)》到貨了
4、CUT&Tag還是ChIP-seq?
5、CUT&Tag實(shí)驗(yàn)中,Protein A/G的巧妙選擇
6、CUT&tag實(shí)驗(yàn)spike in的優(yōu)勢(shì)早知道
7、表觀專題:你的CUT&tag加spike in了嗎?
8、解鎖新技術(shù),玩轉(zhuǎn)表觀研究-CUT&Tag
9、實(shí)力!新升級(jí)CUT&Tag技術(shù)獲批!
10、CUT&Tag測(cè)評(píng) | 蓄勢(shì)已發(fā)的技術(shù)風(fēng)潮
11、干貨分享 | 助力蛋白質(zhì)-DNA互作研究,從ChIP-Seq到CUT&Tag的進(jìn)階之路
12、授權(quán)!CUT&Tag 2 for 1照進(jìn)現(xiàn)實(shí),Multi-CUT&Tag試劑盒
13、CUT&Tag甲醛交聯(lián)及CUT&Tag-qPCR方案