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轉(zhuǎn)化率99.8%!翌圣亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化試劑盒重磅上市!

2023-7-21  閱讀(265)

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轉(zhuǎn)化率99.8%!翌圣亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化試劑盒重磅上市!


 

DNA甲基化是一種重要的表觀遺傳修飾,通過甲基化轉(zhuǎn)移酶的作用下,形成5-甲基胞嘧啶(5-mC);多項(xiàng)研究表明,DNA甲基化與腫瘤早期發(fā)生及腫瘤微小殘留相關(guān),已成為潛力的早篩及MRD的標(biāo)志物。


 
 
什么是亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化?
弱酸性條件下,亞硫酸氫根結(jié)合到未甲基化的C堿基的6位,甲基化的C堿基不會結(jié)合。然后,通過堿處理,結(jié)合了亞硫酸氫根的非甲基化的C被脫氨基和脫亞硫酸根,成為U堿基。即,用亞硫酸氫鹽處理DNA可將胞嘧啶(C)轉(zhuǎn)化為尿嘧啶(U),但5-甲基胞嘧啶(5mC)不會發(fā)生轉(zhuǎn)變。

 

圖1 亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化原理

 

 

亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化的前世今

1970年萌芽期
 
  • Hayats等發(fā)現(xiàn)了胞嘧啶可以通過亞硫酸氫鹽脫氨基且5-甲基胞嘧啶通過亞硫酸氫鹽脫氨基的速度遠(yuǎn)遠(yuǎn)比非甲基化的胞嘧啶慢。

  • 這些研究結(jié)果提示亞硫酸鹽使 DNA中未發(fā)生甲基化的胞嘧啶(C)脫氨基轉(zhuǎn)變成尿嘧啶(U),而甲基化的胞嘧啶保持不變,通過PCR反應(yīng)轉(zhuǎn)化成胸腺嘧啶(T)。

1992年發(fā)展期
 
  • 科學(xué)家們將亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化的轉(zhuǎn)化時(shí)間縮短至18h,轉(zhuǎn)化率可達(dá)99%;

  • 在NGS技術(shù)還未到來之前,亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化已被廣泛使用,但檢測的甲基化位點(diǎn)有限。

Now成熟期
 
  • 隨著NGS技術(shù)的發(fā)展,WGBS及RRBS等甲基化檢技術(shù)的問世,甲基化的研究進(jìn)入一個(gè)新紀(jì)元,可以實(shí)現(xiàn)高通量、單堿基的甲基化分辨率。

  • 通過不斷的技術(shù)的革新,加上*柱膜技術(shù)或超順磁性氧化硅納米磁珠,亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化時(shí)間可短至90min之內(nèi),轉(zhuǎn)化率可達(dá)99.5%以上。

 

 
亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化-DNA甲基化檢測的“金標(biāo)準(zhǔn)"
近幾年,基于DNA甲基化位點(diǎn)的檢測試劑盒陸續(xù)獲批面世。NMPA批準(zhǔn)的甲基化檢測試劑盒大部分為熒光PCR法,主要原因在于熒光PCR法操作簡便,無需在PCR后電泳,且具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、重復(fù)性好等特點(diǎn)。這些甲基化檢測試劑采用的轉(zhuǎn)化方法為亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化法,亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化成為DNA甲基化檢測的“金標(biāo)準(zhǔn)"。
2023年,NMPA陸續(xù)獲批了多個(gè)甲基化檢測試劑盒,甲基化檢測領(lǐng)域持續(xù)炙手可熱!

 

表1.2023 NMPA獲批甲基化檢測產(chǎn)品

(更多的獲批產(chǎn)品可于NMPA查詢)

 

翌圣生物自主研發(fā)的超高轉(zhuǎn)化率亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化試劑,助力腫瘤早篩!

 

 

產(chǎn)品介紹

Hieff® Mag DNA Methylation Bisulfite Kit(Cat#12223)磁珠法DNA甲基化亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化試劑盒能轉(zhuǎn)化未發(fā)生甲基化的胞嘧啶,通過脫氨基反應(yīng)產(chǎn)生尿嘧啶磺酸鹽,發(fā)生甲基化的胞嘧啶則不會被亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化。轉(zhuǎn)化后的DNA經(jīng)過高效吸附核酸的磁珠結(jié)合,再通過洗滌、脫硫和洗脫等步驟富集得到磁珠上的DNA。

 

 

產(chǎn)品優(yōu)勢

 

產(chǎn)品性能

 

 
非甲基化C的轉(zhuǎn)化率:
 
 
糞便脫落細(xì)胞gDNA、cfDNA 、FFPE DNA不同投入量進(jìn)行亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化,樣本中參入1%λDNA和0.5% PUC19DNA,12223ES的轉(zhuǎn)化率>99.5%,5ng以上的樣本投入量,轉(zhuǎn)化率>99.8%。

 

圖2 非甲基化C的轉(zhuǎn)化率

 

 
甲基化C的保護(hù)率:
 
 
糞便脫落細(xì)胞gDNA、cfDNA 、FFPE DNA不同投入量進(jìn)行亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化,樣本中參入1%λDNA和0.5% PUC19DNA,12223ES甲基化C的保護(hù)率>98%。

 

圖3 甲基化C的保護(hù)率

 

 
線性關(guān)系:
 
 

293T gDNA不同投入量進(jìn)行亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)化后的DNA采用甲基化特性行引物進(jìn)行qPCR,不同樣本投入量之間具有良好的線性關(guān)系。

 

圖4.不同樣本投入量轉(zhuǎn)化率之間的線性關(guān)系

 

 
批間穩(wěn)定性:
 
 
采用3個(gè)不同批次的試劑,以293T gDNA不同投入量進(jìn)行亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)化后進(jìn)行NGS測序,3個(gè)批次間的轉(zhuǎn)化率和保護(hù)率具有良好的重復(fù)性

 

表2 不同批次試劑的轉(zhuǎn)化率

 

 
弱陽性臨床樣本的檢出情況:
 
 

采用3個(gè)腸癌弱陽性的糞便樣本,轉(zhuǎn)化后的DNA采用SDC2甲基化特性行引物進(jìn)行qPCR,12223ES轉(zhuǎn)化的檢測體系擁有更高的靈敏度。

 

圖5 SDC2甲基化特異性引物qPCR檢測結(jié)果

 

 

訂購信息

 

 

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品貨號

產(chǎn)品應(yīng)用

Hieff® Mag DNA Methylation Bisulfite Kit(Cat#12223)磁珠法DNA甲基化亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化試劑盒

12223ES

甲基化轉(zhuǎn)化

 

相關(guān)產(chǎn)品

 

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品貨號

產(chǎn)品應(yīng)用

Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for Illumina® V2

甲基化DNA建庫試劑盒V2

12221ES

甲基化文庫構(gòu)建

DNA Methylation Bisulfite Kit  DNA重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化試劑盒

12222ES

甲基化轉(zhuǎn)化

ssDNA Assay Kit

12645ES

單鏈 DNA(ssDNA)定量

1×dsDNA HSAssay Kit

12642ES

雙鏈DNA(dsDNA)定量

Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for Illumina® , Set 1-2

 

12414ES

12415ES

Index

Hieff Canace® Uracil+ High-Fidelity DNA polymerase

10145ES

甲基化轉(zhuǎn)化后PCR擴(kuò)增



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