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組織/細胞RNA提取指南,擺脫選擇綜合征!

2023-8-8  閱讀(426)

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組織/細胞RNA提取指南,擺脫選擇綜合征!

核糖核酸(RNA),存在于生物細胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。RNA的堿基主要有4種,即A(腺嘌呤)、G(鳥嘌呤)、C(胞嘧啶)、U(尿嘧啶),其中,U(尿嘧啶)取代了DNA中的T(胸腺嘧啶)。核糖核酸在體內(nèi)的作用主要是引導蛋白質(zhì)的合成。

 

圖1.DNA和RNA的結(jié)構

 

 

RNA的分類

人體一個細胞含RNA約10pg(含DNA約7pg)。在細胞中,根據(jù)結(jié)構功能的不同,RNA主要分三類,即tRNA(轉(zhuǎn)運RNA),rRNA(核糖體RNA),mRNA(信使RNA)。mRNA含量低,占細胞總RNA的1%~5%。核糖體RNA特點含量高,占細胞總RNA的80%~85%。

表1:RNA的結(jié)構和功能

 

 

特殊RNA

隨著高通量組學技術的應用,在高等哺乳動物中已發(fā)現(xiàn)高達數(shù)十萬種非編碼RNA,根據(jù)結(jié)構與功能可對其進行科學分類和系統(tǒng)命名,如tRNA、rRNA、snRNA、snoRNA、siRNA、miRNA、piRNA和lncRNA等。非編碼RNA是當今生命科學發(fā)展最為迅速的前沿領域之一,它不斷更新人們對生命本質(zhì)的認識,為生物遺傳育種及人類重大疾病的干預、防治和藥物研究等提供全新的思路與技術(Amaral et al,2008)。

圖2.非編碼RNA的生物學功能(Cell. 2019 Nov 14; 179(5): 1033–1055.)

 

RNA研究的第一步為RNA提取,高質(zhì)量的RNA是進行轉(zhuǎn)錄組測序、RT-PCR等試驗的基礎,然而由于RNA單鏈結(jié)構的不穩(wěn)定性和無處不在的RNA酶,使得RNA在提取過程中容易發(fā)生降解,同時,傳統(tǒng)的RNA提取方法毒性大,因此,提取出高質(zhì)量的RNA,選擇合適的提取產(chǎn)品非常重要!

 

動物組織細胞RNA提取

 

對于常規(guī)的新鮮或凍存的組織、貼壁細胞、懸浮細胞RNA提取,我們MolPure® Cell/Tissue Total RNA Kit  細胞/組織總RNA提取試劑盒19221ES,適用于10-20 mg動物組織或(1-5)×106個動物細胞的總RNA提取純化。

 

 
產(chǎn)品特點
 
  • RNA純度高:配有基因組DNA吸附柱,可有效去除DNA污染;

  • 安    全:無需有毒的酚、氯仿等有機物抽提;

  • 快速簡便:無需異丙醇或乙醇沉淀操,操作過程30 min完成;

  • 使用方便:全流程室溫操作,無需冰浴和低溫離心。

 

 
產(chǎn)品性能
 

取106個雜交瘤細胞,分別使用19221和TRIzol(貨號:10606ES)提取總RNA。之后測定濃度和瓊脂糖凝膠電泳;同時取2 μL,使用Hifair® Ⅲ One Step RT-qPCR SYBR Green Kit(貨號:11143ES)進行定量測試小鼠GAPDH。結(jié)果顯示,MolPure® Cell/Tissue RNA Kit能穩(wěn)定提取RNA,RNA產(chǎn)量高,完整度較好。

 

圖 2.RNA 質(zhì)量和濃度

圖3.一步法反轉(zhuǎn)錄定量結(jié)果 (注:綠色為 19221,藍色為 Trizol)

 

 
 
 
 
 
 

 

老師們可能會疑問為什么不Trizol或Trizol相關的產(chǎn)品呢?因為TRIzol有它固有的缺點

 

  • 有難聞的刺鼻氣味

  • 提取過程用到的酚、氯仿都為有毒有機物

  • 提取時間長

 

如果老師們從成本的角度考慮,我們也有性能優(yōu)異的Trizol提取產(chǎn)品。

 

MolPure® TRIeasy Plus Total RNA Kit總 RNA 提取試劑盒(帶離心柱)19211ES是利用MolPure® RNA Column A1和改進的異硫氰酸胍/酚一步法(TRIzol法)來提取樣品中的總RNA,適用于TRIzol法所能提取的所有樣本,包括各種動植物、細菌和細胞樣品。該試劑盒方便快捷,1 h完成可完成操作,且不需要異丙醇沉淀和乙醇洗滌過程。

 

 
產(chǎn)品特點
 
  • 適用范圍廣:可通用動物、植物、細菌、細胞等樣品

  • 使用方便:“TRIzol+離心柱"形式,易于操作 

  • 快速簡便:操作過程1 h完成

 

 
產(chǎn)品性能
 

 

取6×105左右個293T細胞,分別使用19211ES和競品提取總RNA。之后測定濃度和瓊脂糖凝膠電泳;結(jié)果顯示,MolPure® TRIeasy Plus Total RNA Kit 19211ES能穩(wěn)定提取RNA,RNA產(chǎn)量高,純度和完整度較好。

 

圖 4.RNA 質(zhì)量和濃度

TRIeasy™ Total RNA Extraction Reagent TRIeasy™ 總RNA提取試劑 10606ES是一種適用于各種動植物、細菌組織、細胞的總RNA抽提試劑,具有的裂解能力,并有效抑制樣本中RNA的降解,保持RNA的完整性。

TRIeasy™ LS Total RNA Extraction Reagent 液體總RNA提取試劑(同TRIzol LS)19201ES是一種適用于各種動植物、酵母、細菌等液體樣本的總RNA抽提試劑,具有的裂解能力,并有效抑制樣本中RNA的降解,保持RNA的完整性。

MolPure® Cell/Tissue miRNA Kit細胞/組織miRNA提取試劑盒 19331ES適用于TRIzol法所能提取的所有樣本,包括各種動植物、細菌組織和培養(yǎng)細胞中總RNA、miRNA和其他各種小RNA的提取。該試劑盒可選擇提取包含miRNA的總RNA,或只針對microRNA富集,不包含>200 nt其它RNA,30min可完成單樣本的提取。


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