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DNA-蛋白質互作研究解決方案(下)

2023-10-20  閱讀(194)

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DNA-蛋白質互作研究解決方案(下)

 


DNA-蛋白質互作研究解決方案(上)介紹了一些表觀組學技術研究DNA-蛋白質互作,但是有了組學數據,通常還需要一些驗證實驗。


這次,我們來介紹DNA與蛋白質互作研究的驗證實驗。

 

01
雙熒光素酶報告檢測實驗

熒光素酶報告基因是指以熒光素(luciferin)為底物來檢測螢火蟲熒光素酶(fireflyluciferase)活性的一種報告系統(tǒng)。熒光素酶可以催化luciferin氧化成oxyluciferin,在luciferin氧化的過程中,會發(fā)出生物熒光(bioluminescence)。

 

雙熒光素酶實驗能夠進行啟動子活性檢測、轉錄因子鑒定、miRNA 與LncRNA/circRNA/mRNA互作等。

 

 
實驗步驟
 
 

 

 
性能展示
 
 

圖.轉錄因子IRF3對IFN-β啟動子的調控作用

構建Luc-IFN-β啟動子載體和IRF3的過表達載體后進行共轉染實驗,之后雙熒光素酶報告基因檢測顯示轉錄因子IRF3對IFN-β具有調控作用

 

 
產品推薦
 
 

 

產品名稱

貨號

規(guī)格

Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit 雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒HOT

11402ES60/80

100 T/1000 T

Luciferase Reporter Gene Assay Kit 螢火蟲熒光素酶報告基因檢測試劑盒

11401ES60/76/80

100 T/500 T/1000 T

pGM-CMV Luciferase Reporter Plasmid Positive Control pGM-CMV-Luc熒光素酶報告基因質粒陽性對照

11556ES03

1 μg

Luciferase Reporter Plasmid negative control (熒光素酶報告基因質粒陰性對照)

11555ES03

1 μg

pGMLR-CMV Luciferase Reporter Plasmid(pGMLR-CMV海腎熒光素酶報告基因質粒)

11558ES03

1 μg

 

02
CoIP或GST-pull down
CoIP或GST-pull down是研究互作蛋白的技術。在DNA-蛋白質互作研究時,通常會發(fā)現,在調控DNA區(qū)域,會出現多個蛋白共結合的情況,此時可能是蛋白質不同亞型或者不同蛋白組成復合體后發(fā)揮調控功能。這種情況下,需要進行濕實驗驗證,CoIP或者GST-pull down是使用較多的技術。

酵母雙雜交是將待研究的兩種蛋白質分別克?。ㄈ诤希┑浇湍副磉_質粒的轉錄激活因子(如GAL4等)的DNA結合結構域(DNA-BD)和轉錄激活域(AD)上,構建成融合表達載體,從表達產物分析兩種蛋白質相互作用的系統(tǒng)。

 


CoIP

GST-pull down

酵母雙雜交

原理

抗原抗體特異性反應

GST對谷胱甘肽偶聯磁珠得特異性

真核生物轉錄調控過程

檢測瞬時相互作用

檢測弱相互作用

檢測直接相互作用

驗證方式

體內直接或間接相互作用檢測

體外直接得相互作用檢測

體內直接或間接相互作用檢測

是否需要蛋白純化

是否需要抗體

 

 
產品步驟
 
 

CoIP實驗步驟

 

GST-pull down實驗步驟

 

酵母雙雜交實驗步驟

 

 

03
產品推薦

 

產品名稱

貨號

規(guī)格

蛋白A/G瓊脂糖純化樹脂

36403ES03/05/08/25/60

1/2/5/25/100 mL

蛋白A/G瓊脂糖快速純化樹脂

36404ES08/25/60

5 /25 /100 mL

蛋白A/G免疫沉淀磁珠

36417ES03/08

1/5 mL

GSTSep Glutathione MagBeads GST標簽蛋白純化磁珠

20562ES03/05/08/25

1/2/5/25 mL

X-α-Gal 5-溴-4-氯-3-吲哚-α-D-吡喃半乳糖苷

10903ES25/60/72/76

25/100/250/500 mg

Aureobasidin A(AbA) 金擔子素A

60231ES03/08/10

1/5/10 mg

WB/IP裂解液

20118ES60

100 mL

蛋白酶抑制劑Cocktail

20124ES03/10/60/76

1/10/100/500 mL

 



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