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翌圣生物科技（上海）股份有限公司
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表觀遺傳學(xué)是指研究活性和非活性基因表現(xiàn)的遺傳變化。變化的來(lái)源既可以是外在環(huán)境因素，也可以是內(nèi)在因素，例如年齡和疾病。它通常用于診斷潛在疾病并防止其遺傳給后代。IMARC Group的市場(chǎng)調(diào)研報(bào)告顯示2022年全球表觀遺傳學(xué)市場(chǎng)規(guī)模達(dá)21億美元，預(yù)計(jì)到2028年市場(chǎng)規(guī)模將達(dá)到51億美元，2022-2028年復(fù)合年增長(zhǎng)率（CAGR）為15.9%。
眾多表觀遺傳研究技術(shù)中，ATAC-seq（Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing）可謂，自2015年問(wèn)世以來(lái)，，且逐漸成為表觀研究課題必選技術(shù)之一。
ATAC-seq介紹
ATAC-seq全稱(chēng)Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing，即利用轉(zhuǎn)座酶研究染色質(zhì)可進(jìn)入性的高通量測(cè)序技術(shù)。多數(shù)基因組中的染色質(zhì)都緊緊盤(pán)繞在細(xì)胞核內(nèi)，但也有一些區(qū)域經(jīng)染色質(zhì)重塑后呈現(xiàn)出松散的狀態(tài)，這部分無(wú)核小體的裸露DNA區(qū)域被稱(chēng)為開(kāi)放染色質(zhì)（open chromatin），而DNA復(fù)制和基因轉(zhuǎn)錄都發(fā)生在這些區(qū)域。 染色質(zhì)的這種特性叫做染色質(zhì)的易接近性（chromatin accessibility），通過(guò)研究細(xì)胞特定狀態(tài)下開(kāi)放的染色質(zhì)區(qū)域可以在DNA水平上了解其轉(zhuǎn)錄調(diào)控。
開(kāi)放染色質(zhì)區(qū)域：染色質(zhì)是否呈疏松結(jié)構(gòu)是決定轉(zhuǎn)錄功能的關(guān)鍵因素，該區(qū)域通常是一些順式調(diào)控元件結(jié)合區(qū)域；
此時(shí)Tn5酶利用空間位阻效應(yīng)進(jìn)行識(shí)別和切割，Tn5酶會(huì)優(yōu)先整合到主動(dòng)轉(zhuǎn)錄或高度超卷曲的DNA區(qū)域中（即染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)域）。
ATAC-seq技術(shù)應(yīng)用
通過(guò)ATAC-seq可以獲得豐富的表觀遺傳信息，包括開(kāi)放染色質(zhì)圖譜、核小體定位、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)，并通過(guò)鑒定染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)域中轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)，分析得到轉(zhuǎn)錄因子及調(diào)控區(qū)域。
染色體開(kāi)放性圖譜繪制；
胚胎發(fā)育表觀遺傳修飾；
疾病潛在標(biāo)志物的預(yù)測(cè)；
腫瘤發(fā)生表觀機(jī)制研究；
腫瘤分型與微環(huán)境研究。
圖.ATAC研究的開(kāi)放區(qū)域中，DNA結(jié)合蛋白結(jié)合DNA后，影響下游基因的轉(zhuǎn)錄
ATAC建庫(kù)試劑盒優(yōu)勢(shì)
含lysis buffer（細(xì)胞核打孔）；
含ATAC建庫(kù)全套試劑，轉(zhuǎn)座反應(yīng)后的小片段專(zhuān)用純化磁；
含Digitonin和tween-20，增加細(xì)胞核通透性。
ATAC建庫(kù)試劑盒性能
圖.100-10 w細(xì)胞投入量進(jìn)行ATAC建庫(kù)，結(jié)果一致性較高。
圖：凍存細(xì)胞進(jìn)行ATAC建庫(kù)，結(jié)果一致性較高。
注：樣本需要進(jìn)行長(zhǎng)期保存時(shí)，建議用液氮保存，-80℃冰箱保存時(shí)間不超過(guò)4周。
圖：競(jìng)品試劑盒與翌圣ATAC試劑盒進(jìn)行性能對(duì)比，從100-10w細(xì)胞，文庫(kù)結(jié)果一致性較高，且文庫(kù)測(cè)序結(jié)果一致（另外，100個(gè)細(xì)胞投入，翌圣結(jié)果優(yōu)于競(jìng)品）
ATAC技術(shù)文章應(yīng)用
ATAC開(kāi)放性圖譜繪制
Howard Y. Chang教授團(tuán)隊(duì)從癌癥基因組圖譜組織（TCGA）中選取23種癌癥類(lèi)型，410個(gè)腫瘤樣品進(jìn)行ATAC-seq分析，繪制了囊括23種人類(lèi)癌癥類(lèi)型的796個(gè)全基因組染色質(zhì)可接近性圖譜，平均每種癌癥類(lèi)型中鑒定了近十萬(wàn)個(gè)染色質(zhì)可接近性敏感位點(diǎn)，揭示了一系列與染色質(zhì)可接近性有關(guān)的調(diào)控相互作用，這些相互作用可改變與癌癥風(fēng)險(xiǎn)和治療結(jié)果相關(guān)的基因表達(dá)。
The chromatin accessibility landscape of primary human cancers
原發(fā)性人類(lèi)癌癥的染色質(zhì)可及性景觀
期刊：Science IF：41.037
圖.410 個(gè)樣本繪制23種癌癥的染色質(zhì)可及性圖譜
ATAC在胚胎發(fā)育中的遺傳修飾
文章聯(lián)合ATAC-seq和RNA-seq檢測(cè)了早期胚胎發(fā)育過(guò)程中各時(shí)期染色質(zhì)結(jié)構(gòu)開(kāi)放區(qū)域的動(dòng)態(tài)變化，發(fā)現(xiàn)不同時(shí)期的細(xì)胞開(kāi)放區(qū)域的動(dòng)態(tài)變化情況，并得到胚胎發(fā)育時(shí)期關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子，繪制出了小鼠早期胚胎中全基因組易接近性染色質(zhì)圖譜。
The landscape of accessible chromatin in mammalian preimplantation embryos
哺乳動(dòng)物植入前胚胎中可及染色質(zhì)的景觀
期刊：Nature IF：40.137
圖.小鼠著床前胚胎細(xì)胞染色質(zhì)開(kāi)放性可視圖
翌圣生物ATAC建庫(kù)試劑盒為即用型ATAC建庫(kù)試劑盒，將樣本提核后，按照說(shuō)明書(shū)操作，無(wú)需其他試劑，即可構(gòu)建ATAC文庫(kù)。
簡(jiǎn)單且標(biāo)準(zhǔn)化，我們一直在努力！
產(chǎn)品推薦
產(chǎn)品名稱(chēng) | 貨號(hào) | 規(guī)格 |
Hieff NGS® ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina®ATAC建庫(kù)試劑盒 | 12208ES12/48 | 12 T/ 48 T |
Hieff NGS® Tagment Index Kit for Illumina®Tn5建庫(kù)專(zhuān)用接頭 | 12416ES24/96 | 48 T/ 192 T |
1×dsDNA HS Assay Kit | 12642ES60/76 | 100 T/500 T |
Qubit專(zhuān)用檢測(cè)管 | 83509ES03/10 | 500支/5000 支 |
PCR金屬磁力架 | 80460ES03 | 個(gè) |
