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*Z易懂的流式細(xì)胞實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)指南
閱讀:997 發(fā)布時(shí)間:2018-5-8流式細(xì)胞術(shù)是非常讓人著迷的實(shí)驗(yàn)。在眾多醫(yī)學(xué)研究手段里,如果說弱水三千只取一瓢的話,那我會(huì)選流式細(xì)胞術(shù)。從我個(gè)人感受來講,流式細(xì)胞術(shù)高速客觀,具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,能夠處理復(fù)雜樣本并同時(shí)獲取多種參數(shù),zuizui關(guān)鍵的是它性能可靠,可重復(fù)性非常好。
雖然也存在一些局限,但流式細(xì)胞術(shù)比起傳統(tǒng)的細(xì)胞生物學(xué)研究手段來講*可以獲得「獨(dú)孤求敗」的桂冠了;如果算上共聚焦和膜片鉗,當(dāng)真可以算拉動(dòng)現(xiàn)代細(xì)胞生物學(xué)的「三駕馬車」了。
雖然介紹流式細(xì)胞術(shù)的入門文章很多,很多同學(xué)也對(duì)流式細(xì)胞術(shù)耳濡目染已久,看師兄師姐做過無數(shù),可真到自己做的時(shí)候卻又總出問題。據(jù)毛老師多年觀察,很多同學(xué)在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的時(shí)候就埋下了隱患,zui常見的問題就是對(duì)照設(shè)置不合理,zui后導(dǎo)致整體實(shí)驗(yàn)失敗或數(shù)據(jù)不理想。因此,今天我們來談?wù)劤晒Φ牧魇郊?xì)胞實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)都需要設(shè)置哪些對(duì)照。
毫不夸張地說,設(shè)置合理的對(duì)照組是整個(gè)實(shí)驗(yàn)成功的關(guān)鍵;反過來說,如果你掌握了流式實(shí)驗(yàn)如何設(shè)置對(duì)照的精髓,對(duì)整個(gè)免疫學(xué)相關(guān)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)都會(huì)有極大地幫助。
流式對(duì)照至少有 5 種:生物學(xué)對(duì)照,空白對(duì)照,同型對(duì)照(Isotype control),補(bǔ)償對(duì)照(也叫單陽性對(duì)照)和 FMO 對(duì)照,主要目的是為了避免出現(xiàn)的假陽性或假陰性結(jié)果。下面我們以一個(gè)具體的凋亡實(shí)驗(yàn)來看看如何設(shè)置對(duì)照組。下圖是 Annexin V/PI 檢測(cè)凋亡的原理示意圖。
比如有兩組細(xì)胞,一組給予藥物處理(Treat 組),一組給予 DMSO 溶劑(Vehicle 組),擬用 Annexin V/PI 檢測(cè)凋亡,我們來看看都需要設(shè)置哪些對(duì)照。
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生物學(xué)對(duì)照
這個(gè)很容易理解,也是很多同學(xué)zui早設(shè)立的對(duì)照。這里 Vehicle 組就是生物學(xué)對(duì)照組??赡芎芏嗤瑢W(xué)想象力就局限于此了,有了生物學(xué)對(duì)照就夠了唄,還需要額外對(duì)照嗎?答案是肯定的,別忘了流式細(xì)胞術(shù)也是一種免疫學(xué)實(shí)驗(yàn),下面我們繼續(xù)來設(shè)置對(duì)照。
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空白對(duì)照
在流式上機(jī)檢測(cè)前,我們還需準(zhǔn)備額外一組細(xì)胞(正?;蛱幚磉^的皆可),什么染料也不加,作為空白對(duì)照。為什么要設(shè)置空白對(duì)照呢?除了陽性熒光信號(hào)之外,我們還需要排除樣本是否自帶熒光背景,所以要用空白對(duì)照來驗(yàn)證在各個(gè)檢測(cè)通道上的信號(hào)是否都是陰性。
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同型對(duì)照(Isotype control)
這個(gè)對(duì)照很多同學(xué)都比較陌生。這個(gè)還得從抗體結(jié)構(gòu)說起。大家知道抗體是個(gè) Y 字形的,F(xiàn)ab 區(qū)域是特異性識(shí)別抗原的。在做蛋白免疫印跡時(shí),只需考慮 Fab 的特異性就可以了,但是細(xì)胞的話稍微有點(diǎn)不同,因?yàn)橛行┘?xì)胞,特別是免疫細(xì)胞(B 細(xì)胞,T 細(xì)胞,巨噬細(xì)胞等等),它們表面有 Fc 受體,所以這個(gè)同型對(duì)照是為了評(píng)估抗體 Fc 段與靶細(xì)胞的結(jié)合情況。如果還不懂的話請(qǐng)看下圖。
所以在做免疫細(xì)胞的流式檢測(cè)時(shí),我們通常都需要加入 Fc 受體封閉劑,之后再加入目標(biāo)抗體的 isotype 作為同型對(duì)照,來排除細(xì)胞 Fc 受體造成的假陽性結(jié)果。一般試劑商都會(huì)告知該抗體需要使用哪種同型抗體。
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補(bǔ)償對(duì)照(單陽性對(duì)照)
要理解這個(gè)對(duì)照,首先需要知道什么是熒光補(bǔ)償。一圖勝前言,下面這個(gè)示意圖說得比較明白。
簡(jiǎn)單來說,需要使用幾種顏色的抗體,就需要設(shè)置幾種顏色的單陽性對(duì)照。這個(gè)對(duì)照可以用細(xì)胞來做,也可以特殊的微球的來做。這里嚴(yán)重推薦使用補(bǔ)償微球來作為補(bǔ)償對(duì)照,一是能節(jié)約時(shí)間和樣本,二是,有時(shí)候自己做的單陽性對(duì)照效果不佳,陽性信號(hào)不強(qiáng),就失去了補(bǔ)償對(duì)照的意義了。下圖是我用補(bǔ)償微球的效果。
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熒光減一(FMO,F(xiàn)luorescence minus one)對(duì)照
如果只用到兩種顏色的話,這個(gè)對(duì)照可以用單陽性對(duì)照代替,如果三種以上顏色的話,就需要再設(shè)置 FMO 對(duì)照來評(píng)估其他熒光染料的干擾和補(bǔ)償本底,幫助正確設(shè)置陽性門。
下圖演示如果按空白對(duì)照組設(shè)定界線之后得到的細(xì)胞比例比 FMO 設(shè)定的值要大。從這個(gè)圖可以看出,空白對(duì)照僅僅是設(shè)定陰性界線,但非陰性并不等于就是陽性,所以還需 FMO 來設(shè)定陽性界線。再打個(gè)比方,比如人體體溫正常是 37°,小于 37° 肯定不是發(fā)熱,那超過 37° 就一定是發(fā)熱嗎,比如 37.1°?(發(fā)熱的診斷界線是 37.3°)。
所以,綜上所述,如果只檢測(cè)兩種顏色的話,至少需要 5 個(gè)對(duì)照(生物學(xué)對(duì)照 + 空白對(duì)照 + 同型對(duì)照 + 2 個(gè)單陽性對(duì)照)。如果要檢測(cè) 3 種顏色的話,我們來算算,生物學(xué)對(duì)照 + 空白對(duì)照 + 同型對(duì)照(可以不同的 isotype 做在同一管里)+3 個(gè)單陽性對(duì)照 + 3 個(gè) FMO 對(duì)照,一共需要 9 個(gè)對(duì)照。
只有設(shè)置了合理的對(duì)照,才能得到準(zhǔn)確可靠的結(jié)果,小伙伴們 get 到了嗎?下次再去做流式,就不會(huì)被流式的老師懟得無地自容了吧。如果覺得對(duì)您有所啟發(fā),請(qǐng)點(diǎn)個(gè)贊哦,要是感興趣的同學(xué)比較多,我們下次再繼續(xù)談?wù)剺颖咎幚砗皖伾钆涞膯栴}。
zui后想提一點(diǎn)冷知識(shí),流式細(xì)胞術(shù)(Flowcytometry)是近年來流行起來的叫法,但它和 FACS 嚴(yán)格來說不是同一個(gè)意思,F(xiàn)ACS 意思是 Fluorescence activated Cell Sorting,以前老一輩們都叫熒光激發(fā)細(xì)胞分選實(shí)驗(yàn),S 是分選的意思,但實(shí)際上很多流式細(xì)胞儀還只能做到檢測(cè)分析,不能實(shí)現(xiàn)分選,我們只是習(xí)慣用 FACS 來指代流式細(xì)胞檢測(cè)術(shù)而已。