技術(shù)文章
DNA Marker的選購(gòu)與問(wèn)題解答
閱讀:3397 發(fā)布時(shí)間:2018-5-16一、novoprotein DNA Marker特點(diǎn):
- 每個(gè)條帶均為單獨(dú)定量制備
- 可以用于 DNA段大小和濃度的判斷
- 帶型清晰明亮、條帶大小準(zhǔn)確,覆蓋范圍廣(100bp-10kb)
- 明暗條帶優(yōu)化比例,條帶更美觀
- 內(nèi)含上樣緩沖液和指示染料可直接上樣、快捷方便
- 添加了特定穩(wěn)定劑,穩(wěn)定性高,于-20℃可保存兩年以上
- 適用于 TAE 和 TBE緩沖體系
- 可以任選條帶定制DIY DNA Marker
- 價(jià)格優(yōu)勢(shì)明顯
二、如何選擇novoprotein DNA Marker
如圖為novoprotein 在售的18種DNA Marker,可以根據(jù)您的目的片段大小,選擇附近條帶較密的marker,這樣對(duì)目標(biāo)片段大小的估計(jì)較準(zhǔn)確。兩個(gè)不同目的帶同時(shí)電泳時(shí),盡量選擇同時(shí)可以標(biāo)定兩個(gè)目的片段的marker。如果您的實(shí)驗(yàn)有特殊條帶需求,我們還可以為您提供DIY DNA Marker定制服務(wù)。
(DNA Marker電泳圖)
三、novoprotein DNA Marker使用方法及注意事項(xiàng)
使用注意事項(xiàng):
- 建議選擇合適濃度的瓊脂糖凝膠(DNA段越短膠濃度越大:<0.5k,膠濃度1.2-1.5%;>10kb濃度,0.3-0.7%;0.5<DNA<10kb,膠濃度為0.8-1.0%)
- DNA Marker使用前*化凍并混合均勻
- 取5 μl直接加入瓊脂糖凝膠的加樣孔中(約每1 mm點(diǎn)樣孔寬度加1 μl)進(jìn)行電泳
- 低電壓下不受場(chǎng)強(qiáng)影響,分離效果好。一般電壓4-10v/cm,大片段電泳時(shí)注意控制電壓。
- 及時(shí)更換電泳緩沖液
保存注意事項(xiàng):
4℃保存3個(gè)月以上,-20℃保存2年。(如客戶電泳使用頻繁可于室溫隨時(shí)使用,但我們推薦客戶于4℃存放)
DNA Marker 加樣時(shí)盡量使用新槍頭,避免核酸酶污染
四、DNA Marker使用問(wèn)題解析
- 條帶模糊
原因 | 解決方案 |
凝膠濃度不合適 | 根據(jù)片段長(zhǎng)短選擇合適的凝膠濃度 |
電泳緩沖液緩沖能力差 | 反復(fù)使用后緩沖能力下降需及時(shí)更換 |
電壓過(guò)高時(shí)間過(guò)長(zhǎng) | 電壓不應(yīng)該超過(guò)20V/cm,電泳溫度應(yīng)該低于30℃ |
上樣量過(guò)多 | 減少上樣量以marker條帶為準(zhǔn)條帶更清晰 |
電泳膠質(zhì)量不好 | 選擇好膠粉充分溶膠 |
Marker降解 | 防止核酸酶污染,確保保存溫度和時(shí)間 |
亮度不夠或不均一
原因 | 解決方案 |
上樣量少 | 可適度增加上樣量 |
EB濃度低 | 按照要求加入EB,一般為終濃度0.5-1ug/ml |
凝膠不均勻,膠質(zhì)過(guò)厚 | 充分煮膠至透明無(wú)雜質(zhì)和絲狀物,倒膠均勻適量 |
電泳膠亮度不均一 | 電泳時(shí)間過(guò)長(zhǎng)時(shí),瓊脂糖膠前部EB會(huì)遷移至膠后部,造成前后DNA染色亮度不一,可在電泳開始前,在瓊脂糖膠前部,靠近電泳槽陽(yáng)極附近加入少量EB并混勻。 |
條帶污染
原因 | 解決方案 |
污染核酸外切酶至DNA降解 | 使用滅菌的槍頭,及時(shí)蓋緊管蓋 |
點(diǎn)樣時(shí)污染 | 加樣時(shí)及時(shí)更換槍頭 |
五、Marker條帶比較分析
對(duì)市場(chǎng)上熱銷DNA Ladder 2000同類型產(chǎn)品調(diào)查對(duì)比見(jiàn)下表:
公司名稱 | 次數(shù) | 目錄價(jià) | 定量條帶(標(biāo)稱) | 普通條帶(標(biāo)稱) | 備注 |
Takara | 40 | 85 | 30ng/ul | 10ng/ul | 5ul電泳,亮帶150ng,其余50ng |
康為世紀(jì) | 50 | 48 | 30ng/ul | 10ng/ul | 5ul電泳,亮帶150ng,其余50ng |
東盛 | 60 | 90 | 30ng/ul | 15ng/ul | 5ul電泳,亮帶150ng,其余75ng |
SinoBio | 50 | 70 | 20ng/ul | 10ng/ul | 5ul電泳,亮帶100ng,其余50ng |
全式金 | 50 | 70 | 20ng/ul | 10ng/ul | 5ul電泳,亮帶100ng,其余50ng |
天根 | 50 | 90 | 17ng/ul | 8ng/ul | 6ul電泳,亮帶100ng,其余50ng |
由表中可以看出,我們的marker濃度在市場(chǎng)上位于中等水平,從價(jià)格來(lái)看也比較有優(yōu)勢(shì),且我們的活動(dòng)力度較大。(目前marker產(chǎn)品,買二送二)
為了取得美觀的DNA Marker電泳分布圖譜,我們?cè)诋a(chǎn)品制備過(guò)程小幅度調(diào)整了非定量條帶的濃度,結(jié)果使定量條帶更醒目,相對(duì)其他條帶更易區(qū)分。
Marker條帶電泳圖譜比較
- Novoprotein新產(chǎn)品DNA Ladder 2000 plus II
- 2、Novoprotein DNA Ladder 2000
- 3、T 1公司同類型 Marker DL2000
- 4、T 2公司同類型 Marker D2000
(1%瓊脂糖膠,2ul電泳可見(jiàn)novoprotein DNA marker條帶清楚,帶型美觀。)