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技術(shù)文章

T7 體外轉(zhuǎn)錄試劑盒使用手冊(cè)V1.1

閱讀:3394          發(fā)布時(shí)間:2019-5-17

T7 體外轉(zhuǎn)錄試劑盒產(chǎn)品及特點(diǎn) 本試劑盒是基于 T7 RNA 聚合酶的 RNA 體外轉(zhuǎn)錄試劑盒,它利用含有 T7
啟動(dòng)子的模版 DNA,以 NTP 為底物,從 T7 啟動(dòng)子下游開(kāi)始合成與模版 DNA
中一條鏈互補(bǔ)的 RNA,簡(jiǎn)單快速獲得大量的 RNA 分子。本產(chǎn)品具有下列特點(diǎn):
1. 即開(kāi)即用,用戶只需提供含T7 啟動(dòng)子的DNA 模板即可以進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn),
不需要單獨(dú)準(zhǔn)備每一個(gè)成份。
2. 單溶液預(yù)配液,減少加樣次數(shù),避免了操作誤差,增加了可重復(fù)性。
3. 模版 DNA 可以是線性化的質(zhì)粒 DNA,也可以是 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物。
4. 可以合成的 RNA 的長(zhǎng)度在 20nt 到 2000 nt 之間。
5. 產(chǎn)品配方經(jīng)過(guò)精心優(yōu)化,每 ug DNA 模版可以合成 2-6 ug RNA。
6. 得到的 RNA 可以用于 RNA 結(jié)構(gòu)研究、核酶生物化學(xué)、體外翻譯、RNA-蛋
白質(zhì)相互作用、反義技術(shù)、SELEX 技術(shù)和 RNA 干擾(RNAi)等實(shí)驗(yàn)。
7. 本試劑盒足夠 50 次 20uL 體系的體外轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)。 規(guī)格及成分 成份 編號(hào) 十孔盒包裝
T7 轉(zhuǎn)錄預(yù)配液(2×) 91106a 0.5 mL
陽(yáng)性對(duì)照 DNA(1.3 Kb 片段) 91106b
20 uL
(10 ng/uL)
T7 RNA 聚合酶 91106c 50 uL
RNase-free 水 80403 1 mL
使用手冊(cè) 91106sc 1 份
運(yùn)輸及保存 低溫運(yùn)輸,-20℃保存、有效期一年。 自備試劑 Tris 飽和酚、RNase-free 75%乙醇(均可從本公司另購(gòu))
相關(guān)資料 一、制備 DNA 模板(本試劑盒不含所需試劑,此處信息僅供參考)
PCR 片段和質(zhì)粒 DNA 都可以用作體外轉(zhuǎn)錄的模板,但是必須注意以下幾
點(diǎn)。
一是必須使用線性化的 DNA。如果是質(zhì)粒 DNA,則必須先用適當(dāng)?shù)南拗菩?br />內(nèi)切酶切成線狀。
二是需要轉(zhuǎn)錄的DNA 序列的上游必須有T7 啟動(dòng)子。如果模板是PCR 產(chǎn)物,
則可以在設(shè)計(jì)引物時(shí)將 T7 啟動(dòng)子序列(5’TAA TAC GAC TCA CTA TAG
GG 3’)加上。如果是將 DNA 片段克隆到載體上,則需要選擇有 T7 啟動(dòng)
子的載體,并且克隆位點(diǎn)必須位于 T7 啟動(dòng)子下游。
三是需要轉(zhuǎn)錄的 DNA 序列的下游端不要是 3’突出。如果是 3’突出
(比如選擇了 Pst I 來(lái)線性化質(zhì)粒),則用 T4 DNA 聚合酶修平。
四是必須保證 DNA 模板中沒(méi)有 RNase。由于提取質(zhì)粒 DNA 的過(guò)程中一般
要使用大量的 RNase A,因此質(zhì)粒 DNA 一般都有嚴(yán)重的 RNase A 污染,
所以在用作模板前,采取膠回收得方法回收質(zhì)粒 DNA。并且加入少量
總 RNA 一起保溫,然后電泳檢測(cè) RNA 是否被降解,以此來(lái)判斷純化的 DNA
模板是否有殘留 RNase A。如果有 RNase 污染,則必須反復(fù)酚-抽提
去除殘留的 RNase,然后再乙醇沉淀質(zhì)粒 DNA。
二、體外轉(zhuǎn)錄反應(yīng)
1. 在兩個(gè) RNase-free 的塑料離心管中,在室溫下(不是在 4℃下)分別按次
序加入下列成分(T7 轉(zhuǎn)錄預(yù)配液容易產(chǎn)生結(jié)晶沉淀,一定要握在手中直到
結(jié)晶*溶解并搖勻后方可使用):
注:此為 20uL 反應(yīng)體系的用量,對(duì)其他反應(yīng)體系,各成分的用量可以
按比例增減。本產(chǎn)品的 T7 轉(zhuǎn)錄預(yù)配液已經(jīng)含有NTP。如果需要標(biāo)記 RNA
探針,則需要訂購(gòu) NTP 分開(kāi)的試劑盒。如果需要得到加帽 RNA,則需
要加入自備的加帽修飾核苷酸(NEB 公司有此產(chǎn)品)。
2. 37℃保溫 1-2 小時(shí)。注意:延長(zhǎng)保溫時(shí)間并不能提高產(chǎn)量。
3. 70℃加熱 10 分鐘滅活 T7 RNA 聚合酶。
4. 取 1-3 uL 電泳檢測(cè)轉(zhuǎn)錄效果。一般 1 ug DNA 可以合成 5-10 ug 的 RNA。
5. 得到的 RNA 可以放-80℃保存。如需去除 DNA 模板,請(qǐng)按下面步驟操作。
三、去除 DNA 模板(所需試劑需要另購(gòu))
1. 在體外轉(zhuǎn)錄體系中加入 1 uL 自備的 RNase-free DNase (3-5 U/uL)。
成分 樣品管 對(duì)照管
DNA 模板
PCR 片段
質(zhì)粒 DNA
50 ng 左右
1 ug 左右
不加
陽(yáng)性對(duì)照片段 不加 4 uL
T7 轉(zhuǎn)錄預(yù)配液,2× 10 uL 10 uL
T7 RNA 聚合酶 1 uL 1 uL
RNase-free 水 補(bǔ)水到 20uL 補(bǔ)水到 20uL
2. 37℃保溫 15-30 分鐘。
3. 補(bǔ)水到 100 uL。
4. 用自備的等體積(100 uL)的 Tris 飽和酚-抽提一次去除殘留的 DNase
和 RNA 聚合酶。
5. 加自備的 200 uL 無(wú)水乙醇,振蕩后 15000 rpm 離心 20-30 分鐘,棄上
清(含 NTP 和鹽離子等成分)。
6. 加入 1mL 75%乙醇,震蕩 10秒后15000rpm 離心3-5 分鐘,棄上清。
7. 短暫離心數(shù)秒,用槍頭吸棄上清。
8. 晾干,所得沉淀即體外轉(zhuǎn)錄所得的 RNA??扇苡?RNase-free 水中后立即
使用或放-80℃長(zhǎng)期保存。 疑難解答 1、沒(méi)有 RNA 產(chǎn)物。常見(jiàn)原因是模板有 RNase 污染,可用純化的 RNA 跟模
板DNA 一起保溫,再檢測(cè) RNA 是否降解。還可以增加 RNase Inhibitor
用量,本試劑盒緩沖液和酶混合液中有 RNase inhibitor,如果模板 RNase
污染嚴(yán)重,可能需要用戶補(bǔ)加 RNase inhibitor。
2、RNA 產(chǎn)量低。常見(jiàn)的原因是 DNA 模板。在轉(zhuǎn)錄序列的個(gè)和第二個(gè)堿
基都是 G,在前 14 個(gè)堿基內(nèi)避免有 U 存在。
3、RNA 長(zhǎng)度比預(yù)期的短??赡苁悄0逍蛄兄杏?T7 RNA 聚合酶的終止序列。
可以改用 SP6 體外轉(zhuǎn)錄試劑盒(啟動(dòng)子也必須改成 SP6 啟動(dòng)子)。
4、RNA 長(zhǎng)度比預(yù)計(jì)的長(zhǎng)。T7 RNA 聚合酶跟 Taq DNA 聚合酶一樣,有不依賴
于模板的加尾功能,多有一半的 RNA 可以帶一個(gè)或兩個(gè)堿基的尾巴。如
果 RNA 長(zhǎng)度比預(yù)計(jì)的長(zhǎng)很多,使用的模板又是質(zhì)粒 DNA,則可能是質(zhì)粒
DNA 線性化不*。
5、5’單磷酸還是三磷酸。如果使用 GTP,則得到的 RNA 是三磷酸,體外轉(zhuǎn)
錄時(shí)如果保溫時(shí)間太長(zhǎng)(如 12 小時(shí)),則有 50%的三磷酸會(huì)變成單磷酸。
如果在轉(zhuǎn)錄體系中加入 GMP,則 T7 RNA 聚合酶將優(yōu)先使用 GMP,所得
RNA 產(chǎn)物中 5’端是單磷酸的比例將大大增加。
6、用體外轉(zhuǎn)錄試劑盒如何得到帶帽 RNA?
7、需加入帶帽 NTP 類似物即可。 關(guān)聯(lián)產(chǎn)品 SP6 體外轉(zhuǎn)錄試劑盒 (CAT#:91106-50)
180413d

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