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技術(shù)文章

牛細小病毒探針法熒光定量PCR試劑盒

閱讀:325          發(fā)布時間:2019-7-29

產(chǎn)品及特點

牛細小病毒(Bovine Parvovirus,BPV) 會引發(fā)牛細小病毒感染,是一種接觸性傳染病,以下痢為主要癥狀,其特征是母牛生殖機能障礙,導(dǎo)致妊娠母牛感染導(dǎo)致流產(chǎn)、死胎,犢牛感染則表現(xiàn)腸炎、腹瀉。牛細小病毒感染在牛群中發(fā)生比較廣泛,目前國內(nèi)外對其研究的較少,發(fā)生此病的國家也不多,本產(chǎn)品就是以染料熒光定量PCR技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)的專門檢測牛細小病毒的試劑盒,它具有下列特點:

  • 即開即用,用戶只需要提供樣品DNA模板。
  • 引物和探針經(jīng)過優(yōu)化,靈敏性高。
  • 提供陽性對照,便于區(qū)分假陰性樣品。
  • 特異性高,引物是根據(jù)牛細小病毒高度保守區(qū)設(shè)計,不會跟其他病毒的DNA發(fā)生交叉反應(yīng)。
  • 本產(chǎn)品足夠50次20μL體系的探針法熒光定量PCR反應(yīng)。
  • 本產(chǎn)品只能用于科研。

 

規(guī)格及成分

編號

十孔包裝

2×Probe qPCR MagicMix

190303

0.5 mL(本色蓋)

熒光PCR模板稀釋液

180701

1 mL(黃蓋)

牛細小病毒 PCR引物

15-44000yw

100 μL(白

牛細小病毒 qPCR探針

15-44000pro

100 μL(棕色管)

牛細小病毒陽性對照2.0

(1×10E8拷貝/μL)

15-44000pc

50 μL(紅

天凈沙核酸釋釋劑試用裝

61202

50次(2.5mL)

使用手冊

15-44000sc

1份

 

 

運輸及保存

低溫運輸,-20℃保存,保存期限為12個月。

 

自備試劑

樣品DNA。

 

使用方法

一、稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品(以10E2-10E7拷貝/μL這6個10倍稀釋度為例)。由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性的DNA片段作為陽性對照。

  • 標(biāo)記6個離心管,分別為7,6,5,4,3,2。
  • 用帶芯槍頭分別加入45 μL熒光PCR模板稀釋液,用帶芯槍頭,下同)。
  • 7號管中加入5 μL 10E8拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得10E7拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
  • 換槍頭,在6號管中加入5 μL 10E7拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得10E6拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
  • 換槍頭,在5號管中加入5 μL 10E6拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得10E5拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
  • 重復(fù)上面的操作直到得到6個稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。

二、樣品DNA的制備

  • 如果有N個樣品,設(shè)置N+2個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照)一個是NC樣品制備陰性對照)??梢杂?0μL陽性對照的10000倍稀釋液再加上一定量的水使總體積跟次制備要求的體積一樣,以此作為PC另外用水作為NC。
  • 用自選方法純化樣品的DNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒DNA提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的病毒DNAout。本試劑盒免費贈送50次免DNA提取的天凈沙核酸釋放劑試用裝,該釋放劑的裂解液可以直接作為PCR模板,省略了DNA提取步驟。

三、Probe qPCR反應(yīng)(20μL體系,在樣品制備室進行

  • 如果只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+9個PCR管,其中N+2個于上步得到的N+2個樣品1個用于PCR陰性對照,6個用標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。
  • 標(biāo)記管中下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋子儲存后后加):

成分

樣品管

N+2

PCR陰性對照管

標(biāo)準(zhǔn)曲線

樣品管(2-7管)

2×Probe qPCR MagicMix

10 μL

10 μL

各10 μL

牛細小病毒 qPCR探針

2 μL

2 μL

各2 μL

牛細小病毒 PCR引物混合液

2 μL

2 μL

2 μL

 待測樣品DNA模板

6 μL

不加

不加

第7步所得標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品稀釋液(2-7

不加

不加

6μL(2號樣到2號管,3號樣到3號管

  • 蓋上蓋子后上機,按下面參數(shù)進行PCR:

過程

溫度

時間

預(yù)變性

94

5 min

PCR反應(yīng)

40個循環(huán))

94

0.5 min

55

0.5 min(采集FAM通道的熒光信號

72℃

0.5 min

后延伸

72

  • min
  • 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,推算出其濃度。
  • 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照Ct必須大于或等于40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct值應(yīng)該小于或等于30。對待測樣品,如果其Ct大于或等于40則為陰性,如果小于或等于35則為陽性。如果在35-40之間,則重復(fù)一次。重復(fù)實驗的Ct值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽性。

 

編號

十孔包裝

2×Probe qPCR MagicMix

190303

0.5 mL(本色蓋)

熒光PCR模板稀釋液

180701

1 mL(黃蓋)

牛細小病毒 PCR引物

15-44000yw

100 μL(白

牛細小病毒 qPCR探針

15-44000pro

100 μL(棕色管)

牛細小病毒陽性對照2.0

(1×10E8拷貝/μL)

15-44000pc

50 μL(紅

天凈沙核酸釋釋劑試用裝

61202

50次(2.5mL)

使用手冊

15-44000sc

1份

 

 

低溫運輸,-20℃保存,保存期限為12個月。

 

樣品DNA。

 

一、稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品(以10E2-10E7拷貝/μL這6個10倍稀釋度為例)。由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性的DNA片段作為陽性對照。

  • 標(biāo)記6個離心管,分別為7,6,5,4,3,2。
  • 用帶芯槍頭分別加入45 μL熒光PCR模板稀釋液,用帶芯槍頭,下同)
  • 7號管中加入5 μL 10E8拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得10E7拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
  • 換槍頭,在6號管中加入5 μL 10E7拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得10E6拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
  • 換槍頭,在5號管中加入5 μL 10E6拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得10E5拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
  • 重復(fù)上面的操作直到得到6個稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。

二、樣品DNA的制備

  • 如果有N個樣品,設(shè)置N+2個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照)一個是NC樣品制備陰性對照)??梢杂?0μL陽性對照的10000倍稀釋液再加上一定量的水使總體積跟次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為NC。
  • 用自選方法純化樣品的DNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒DNA提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的病毒DNAout。本試劑盒免費贈送50次免DNA提取的天凈沙核酸釋放劑試用裝,該釋放劑的裂解液可以直接作為PCR模板,省略了DNA提取步驟。

三、Probe qPCR反應(yīng)(20μL體系,在樣品制備室進行

  • 如果只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+9個PCR管,其中N+2個于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照,6個用標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。
  • 標(biāo)記管中下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋子儲存后后加):

成分

樣品管

N+2

PCR陰性對照管

標(biāo)準(zhǔn)曲線

樣品管(2-7管)

2×Probe qPCR MagicMix

10 μL

10 μL

各10 μL

牛細小病毒 qPCR探針

2 μL

2 μL

各2 μL

牛細小病毒 PCR引物混合液

2 μL

2 μL

2 μL

 待測樣品DNA模板

6 μL

不加

不加

第7步所得標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品稀釋液(2-7

不加

不加

6μL(2號樣到2號管,3號樣到3號管

  • 蓋上蓋子后上機,按下面參數(shù)進行PCR:

過程

溫度

時間

預(yù)變性

94

5 min

PCR反應(yīng)

40個循環(huán))

94

0.5 min

55

0.5 min(采集FAM通道的熒光信號

72℃

0.5 min

后延伸

72

  • min
  • 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,推算出其濃度。
  • 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照Ct必須大于或等于40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct值應(yīng)該小于或等于30。對待測樣品,如果其Ct大于或等于40則為陰性,如果小于或等于35則為陽性。如果在35-40之間,則重復(fù)一次。重復(fù)實驗的Ct值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽性。

 

牛細小病毒可視化LAMP檢測試劑盒

 

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