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技術文章

人皰疹病毒8型染料法熒光定量PCR試劑盒

閱讀:340          發(fā)布時間:2019-8-19

產品及特點

人皰疹病毒8型(Human Herpesvirus-8,HHV-8) 會引起人類的原發(fā)和繼發(fā)感染,原發(fā)感染兒童多見,水痘的出疹突發(fā),常出現(xiàn)紅色皮疹斑疹,繼續(xù)發(fā)展為成串水皰、膿皰,后結痂。病情一般較輕,但偶可并發(fā)間質性肺炎和感染后腦炎該病毒對人體健康造成嚴重損害,因此快速檢測人皰疹病毒8型具有重要意義。為此本公司開發(fā)了簡單快捷的人皰疹病毒8型染料熒光定量PCR檢測試劑盒,它具有下列特點:

  • 即開即用,用戶只需要提供病毒樣品。
  • 根據人皰疹病毒8型保守序列設計的專一性引物,與相關病毒無交叉反應。
  • 靈敏度可以達到幾百拷貝/反應
  • 一管式熒光定量PCR檢測,避免后續(xù)污染。
  • 本試劑盒足夠50次20μL反應體系的熒光定量PCR。
  • 本產品只適用于科研,不能用于臨床診斷。

 

規(guī)格及成分

編號

十孔包裝

2×qPCR MagicMix

90408

500μL(棕色管)

熒光PCR模板稀釋液

180701

1 mL(黃蓋)

人皰疹病毒8型染料法qPCR引物混合物

14-30280yw

100μL(白蓋)

人皰疹病毒8型染料法qPCR陽性對照

(10E8 拷貝/μL)

14-30280pc

50μL(黃蓋)

天凈沙核酸釋放劑試用裝)

61202

20次1 mL,綠蓋

使用手冊

14-30280sc

1份

 

 

運輸及保存

低溫運輸、-20℃保存,有效期一年。

 

自備試劑

DNA模板、10×ROX(根據機型決定,具體見使用方法。

 

使用方法

一、稀釋PCR陽性對照(以10E2-10E7拷貝/μL這6個10倍稀釋度為例)

  • 注意由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原,本產品不提供活體樣品做陽性對照,只提供可以直接使用DNA片段作為陽性對照。
  • 標記6個離心管,分別為7,6,5,4,3,2。
  • 用帶芯槍頭分別加入45 μL熒光PCR模板稀釋液(用帶芯槍頭,下同)。
  • 7號管中加入5 μL 10E8拷貝/μL 的陽性對照,充分震蕩1分鐘,得10E7拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。
  • 換槍頭,在6號管中加入5 μL 10E7拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得10E6拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。
  • 換槍頭,在5號管中加入5 μL 1×10E6拷貝/μL的陽性對照到5號管中,充分震蕩1分鐘,得10E5拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。
  • 重復上面的操作直到得到6個稀釋度的陽性對照。放冰上待用。

二、樣品DNA的制備

  • 如果有N個樣品,必須設置N+2個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照)一個是NC樣品制備陰性對照)。可以用10μL上步制備PCR陽性對照的4濃度為1×10E4 拷貝/μL,10μL相當于1萬拷貝或第5號濃度為1×10E5 拷貝/μL,10μL相當于10拷貝加上一定量的水使總體積跟次制備要求的體積一樣以此作為PC。另外用水作為NC。如果每次制備需要200μL樣品,PC和NC的體積也必須是200μL。
  • 用自選方法純化樣品的DNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒DNA提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的一管式病毒DNAout其升級版病毒DNAout。本試劑盒免費贈送20次免核酸提取的天凈沙核酸釋放劑,其使用手冊可

三、設置qPCR反應(20 μL體系,在樣品制備室進行

  • 如果做定量分析并且只做1次重復,則標記N+9個PCR管,其中N+2個于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照,6個用標準曲線。如果做定性分析,并且只做1次重復,則標記N+4個PCR管,其中N+2個于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照(用水做模板),1個用于PCR性對照(用第4號陽性對照稀釋液,濃度為10000拷貝/μL。下面只描述定量分析的步驟,定性分析只是把6個標曲反應縮減成1個,其余不變。
  • 標記管中下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋子儲存后后加):

成分

樣品管

N+2

PCR陰性對照管

PCR陽性

對照管(2-7管)

2×qPCR MagicMix

10 μL

10 μL

各10 μL

人皰疹病毒8型染料法qPCR引物混合液

2 μL

2 μL

2 μL

自備10×ROX (見注)

2 μL

2 μL

各2 μL

 N+2待測樣品DNA模板

6 μL

不加

不加

第7步所得PCR陽性對照

稀釋液(2-7

不加

不加

6μL(2號樣到2號管,3號樣到3號管

注:僅ABI7500、7700和7900儀器需要使用ROX作為對照,其他熒光PCR儀器(如iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene 3000、RotorGene 6000和LightCycler480)不需要使用ROX,則用水替代。

  • 蓋上蓋子后上機,按下面參數(shù)進行PCR(具體PCR參數(shù)可以根據儀器不同而自行優(yōu)化)。

過程

溫度

時間

預變性

95

5分鐘

PCR反應

(40個循環(huán))

95

15 秒

60

60 秒(采集FAM通道的熒光信號)

  • 數(shù)據采集

具體操作按所用儀器推薦的流程進行。本產品中所含的熒光染料在不結合DNA時,大吸收光譜在471 nm,結合DNA時的大吸收光譜在500 nm,大發(fā)射光譜在530 nm。信號采集可以設置在復性或延伸步驟。

  • 數(shù)據處理
  • 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的Ct值從標準曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,推算出其濃度。
  • 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照Ct必須大于或等于40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct值應該小于或等于30。對待測樣品,如果其Ct大于或等于40則為陰性,如果小于或等于35則為陽性。如果在35-40之間,則重復一次。重復實驗的Ct值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽性。

 

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