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技術(shù)文章

超廣譜β-內(nèi)酰胺酶大腸桿菌(大腸埃希氏菌)探針法熒光定量PCR試劑盒

閱讀:403          發(fā)布時(shí)間:2019-9-6

產(chǎn)品及特點(diǎn)

超廣譜β-內(nèi)酰胺酶大腸埃希菌(ESBL-Escherichia coli)是一種在醫(yī)院內(nèi)感染的常見機(jī)會(huì)致病菌,各臨床科室以及標(biāo)本類型中均有檢出,科室分布以普外科為主,標(biāo)本類型以傷口分泌物標(biāo)本為主,常引起外殼感染性疾病,該細(xì)菌對(duì)多種抗生素有較強(qiáng)的耐藥性,所以醫(yī)院要加強(qiáng)對(duì)該細(xì)菌的耐藥性的檢測(cè)與監(jiān)控,積極做好細(xì)菌的培養(yǎng)和藥物敏感性試驗(yàn),規(guī)范合理使用抗生素,以控制耐藥菌的出現(xiàn)和流行,因此快速檢測(cè)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶大腸埃希菌具有重要意義。熒光定量PCR是檢測(cè)傳染性疾病的主流技術(shù),本產(chǎn)品就是以染料熒光定量PCR技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)的專門檢測(cè)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶大腸埃希菌的試劑盒,它具有下列特點(diǎn):

  • 即開即用,用戶只需要提供樣品DNA模板。
  • 引物和探針經(jīng)過優(yōu)化,靈敏性高。
  • 提供陽性對(duì)照,便于區(qū)分假陰性樣品。
  • 特異性高,引物是根據(jù)人超廣譜β-內(nèi)酰胺酶大腸埃希菌高度保守的VP1區(qū)設(shè)計(jì),不會(huì)跟其他微生物的DNA發(fā)生交叉反應(yīng)。
  • 本產(chǎn)品足夠50次20μL體系的探針法熒光定量PCR反應(yīng)。
  • 本產(chǎn)品只能用于科研。

 

規(guī)格及成分

編號(hào)

十孔包裝

2×Probe qPCR MagicMix

190303

0.5 mL(本色蓋)

熒光PCR模板稀釋液

180701

1 mL(黃蓋)

超廣譜β-內(nèi)酰胺酶大腸埃希菌PCR引物

15-66100yw

100 μL(白

超廣譜β-內(nèi)酰胺酶大腸埃希菌qPCR探針

15-66100pro

100 μL(棕色管)

超廣譜β-內(nèi)酰胺酶大腸埃希菌陽性對(duì)照2.0

(1×10E8拷貝/μL)

15-66100pc

50 μL(紅

天凈沙DNA釋放劑試用裝

130982

50次(試用裝)

使用手冊(cè)

15-66100sc

1份

 

 

運(yùn)輸及保存

低溫運(yùn)輸,-20℃保存,保存期限為12個(gè)月。

 

自備試劑

樣品DNA。

 

使用方法

一、稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品(以10E2-10E7拷貝/μL這6個(gè)10倍稀釋度為例)。由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對(duì)照,只提供無傳染性的DNA片段作為陽性對(duì)照。

  • 標(biāo)記6個(gè)離心管,分別為7,6,5,4,3,2。
  • 用帶芯槍頭分別加入45 μL熒光PCR模板稀釋液,用帶芯槍頭,下同)
  • 7號(hào)管中加入5 μL 10E8拷貝/μL 的陽性對(duì)照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得10E7拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
  • 換槍頭,在6號(hào)管中加入5 μL 10E7拷貝/μL 的陽性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得10E6拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
  • 換槍頭,在5號(hào)管中加入5 μL 10E6拷貝/μL 的陽性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得10E5拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
  • 重復(fù)上面的操作直到得到6個(gè)稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。

二、樣品DNA的制備

  • 如果有N個(gè)樣品,設(shè)置N+2個(gè)提取,多出的一個(gè)是PC(樣品制備陽性對(duì)照),一個(gè)是NC樣品制備陰性對(duì)照)??梢杂?0μL陽性對(duì)照的10000倍稀釋液再加上一定量的水使總體積跟次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為NC。
  • 用自選方法純化樣品的DNA,本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù)細(xì)菌DNA提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的細(xì)菌DNAout細(xì)菌DNAout。本試劑盒免費(fèi)贈(zèng)送50次免DNA提取的天凈沙DNA釋放劑,本產(chǎn)品的裂解液可以直接作為PCR模板,省略了DNA提取步驟。

三、Probe qPCR反應(yīng)(20μL體系,在樣品制備室進(jìn)行

  • 如果只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+9個(gè)PCR管,其中N+2個(gè)于上步得到的N+2個(gè)樣品,1個(gè)用于PCR陰性對(duì)照,6個(gè)用標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。
  • 標(biāo)記管中下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對(duì)照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對(duì)照,并且陽性對(duì)照樣品要等所有管子蓋子儲(chǔ)存后后加):

成分

樣品管

N+2個(gè)

PCR陰性對(duì)照管

標(biāo)準(zhǔn)曲線

樣品管(2-7管)

2×Probe qPCR MagicMix(本色蓋)

10 μL

10 μL

各10 μL

超廣譜β-內(nèi)酰胺酶大腸埃希菌 qPCR探針(綠

2 μL

2 μL

各2 μL

超廣譜β-內(nèi)酰胺酶大腸埃希菌 PCR引物混合液(白

2 μL

2 μL

2 μL

 待測(cè)樣品DNA模板

6 μL

不加

不加

第7步所得標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品稀釋液(2-7號(hào)

不加

不加

6μL(2號(hào)樣到2號(hào)管,3號(hào)樣到3號(hào)管

  • 蓋上蓋子后上機(jī),按下面參數(shù)進(jìn)行PCR:

過程

溫度

時(shí)間

預(yù)變性

94

5 min

PCR反應(yīng)

40個(gè)循環(huán))

94

0.5 min

50

0.5 min(采集FAM通道的熒光信號(hào)

72℃

0.5 min

后延伸

72

  • min

、數(shù)據(jù)處理

  • 以陽性對(duì)照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測(cè)樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,推算出其濃度。

六、電泳檢測(cè)

  • 如果必要電泳確認(rèn),可取10-20μL PCR產(chǎn)物直接在瓊脂糖凝膠上電泳產(chǎn)物的大小為400 bp。但電泳非常容易污染實(shí)驗(yàn)環(huán)境,建議不輕易采納。

 

關(guān)聯(lián)產(chǎn)品

超廣譜β-內(nèi)酰胺酶大腸埃希菌可視化LAMP檢測(cè)試劑盒

 

 

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