作者：互聯(lián)網(wǎng)    日期：2019-12-31

       在臨床和研究環(huán)境中，血液都是對人類進行分子分析的主要來源，并且是許多治療策略的目標，這突顯了需要對構(gòu)成人類血液的細胞進行全面的分子圖譜構(gòu)建。人類蛋白質(zhì)圖譜計劃是一個開放式數(shù)據(jù)庫，旨在通過整合各種組學(xué)技術(shù)（包括基于抗體的成像）來繪制所有人類蛋白的圖譜。
       在此之前，人類蛋白質(zhì)圖譜包括來自外周血單核細胞的基因表達信息，但不包括來自許多其他血細胞亞群的基因表達信息。為了提高分辨率，人們需要對血液中的細胞進行了深入表征，以提供人血細胞中基因表達的詳細細節(jié)，并將它們與體內(nèi)的其他組織相關(guān)聯(lián)在一起。

       在一項新的研究中，來自瑞典卡羅林斯卡研究所等研究機構(gòu)的研究人員對通過流式細胞儀分選技術(shù)分離出的18種經(jīng)典免疫細胞群體進行了基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)的表達分析。將血細胞表達譜與組織表達譜相結(jié)合在一起，包括來自外部來源的轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)以擴大這個開放式數(shù)據(jù)庫中包含的組織類型和大腦區(qū)域的數(shù)量。依據(jù)血細胞和組織中的表達特異性和分布對蛋白編碼基因進行了全基因組分類。

      這些研究人員提供了人體血細胞中所有蛋白編碼基因的表達圖譜，并根據(jù)人體所有主要組織和器官中所有蛋白編碼基因的特異性和分布進行分類。對血細胞RNA表達譜進行全基因組分析可以鑒定出在各種免疫細胞中的表達水平上調(diào)的基因，從而確認了之前已知的蛋白標志物，而且還鑒定出新靶標以進行深入分析。有1448個蛋白編碼基因在單個免疫細胞類型中大量地表達。進一步研究相應(yīng)的蛋白以探索與各個細胞表型相關(guān)的生物學(xué)功能將是有趣的。
       所有細胞類型富集和群體富集的基因網(wǎng)絡(luò)圖顯示，許多細胞類型富集的基因存在于中性粒細胞、酸性粒細胞和漿細胞樣樹突細胞中，而T細胞和B細胞中的許多表達水平上調(diào)的基因在這些淋巴細胞的不同亞群中發(fā)生群體富集。為了說明這種資源的有效性，這些研究人員揭示了已知會導(dǎo)致人類原發(fā)性免疫缺陷的基因在細胞中的分布，并發(fā)現(xiàn)其中的許多基因在目前與這些疾病無關(guān)的細胞中表達，這就揭示了這種全局圖譜如何幫助科學(xué)家們更好地了解特定基因在人體不同細胞和組織中的功能。
       這些研究人員對分選出的血液免疫細胞群體中的蛋白編碼基因進行了全基因組范圍內(nèi)的轉(zhuǎn)錄組分析，以描述所有細胞類型中每個基因的表達水平。所有數(shù)據(jù)均作為人類蛋白質(zhì)圖譜（Human Protein Atlas）的一部分提供在交互式的可以開放存取的血液圖譜（Blood Atlas）中，并與所有主要組織的表達譜整合在一起，以提供所有蛋白編碼基因的空間分類。這允許對人類免疫細胞群體中的表達譜以及所有主要人類組織和器官中的表達譜進行全基因組探索。