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技術(shù)文章

有了這一篇,再也不用問別人,WB蛋白樣品制備常見問題大全!

閱讀:1654          發(fā)布時(shí)間:2021-9-8

 一直都在做蛋白研究,但是樣品制備中的小細(xì)節(jié)你都了解嗎?這里為大家整理了蛋白樣品制備中大大小小的常見問題,一起來學(xué)習(xí)吧!



Q

貼壁細(xì)胞收集是刮下來好還是胰酶消化好?
A

兩種方式都是可行的,各有利弊。不必?fù)?dān)心刮刀收集會(huì)刮壞細(xì)胞,胰酶消化的程度掌握不好,也會(huì)讓細(xì)胞破損。胰酶消化可能會(huì)對(duì)某些膜蛋白產(chǎn)生影響,刮刀收集效率會(huì)略低,可根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)來選擇細(xì)胞收集的方式。做總蛋白提取時(shí),可選擇直接在器皿中進(jìn)行裂解,無需提前收集。

PS:使用刮刀收集時(shí),可加入PBS幫助收取細(xì)胞。


Q

所有WB實(shí)驗(yàn)都用總蛋白就可以完成嗎?
A

當(dāng)然不是,要根據(jù)WB的實(shí)驗(yàn)?zāi)康膩泶_定提取哪類蛋白,如需驗(yàn)證某些低豐度蛋白,或蛋白定位,或組分間表達(dá)量對(duì)比,則需要進(jìn)行亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)分離或組分分離。


Q

提蛋白時(shí)要不要加蛋白酶抑制劑和磷酸酶抑制劑?
A

蛋白樣品如果長期保存,或者下游實(shí)驗(yàn)過程較長,建議加入蛋白酶抑制劑。做磷酸化研究,一定要加入磷酸酶抑制劑!


Q

如需添加蛋白酶抑制劑該如何添加?
A

內(nèi)源性蛋白酶存在于胞漿中,所以要在細(xì)胞裂解前加入抑制劑到達(dá)最佳抑制效果,提取時(shí)將抑制劑添加到裂解液中,工作濃度1X。例如100X蛋白酶抑制劑,1ml裂解液中添加10ul即可。


Q

用RIPA提取總蛋白為什么會(huì)有粘稠的不可溶沉淀?是什么?如何解決?
A

產(chǎn)生粘稠物的主要原因是RIPA不能將所有樣品全部裂解,產(chǎn)生的不可溶組分中主要含有核酸殘團(tuán),細(xì)胞碎片(有些組織樣品還含有油脂),和部分蛋白,因此RIPA提取的僅僅是可溶性蛋白,并非真正的總蛋白。

解決方案:使用柱式法蛋白提取真正意義上的總蛋白


Q

不同時(shí)間點(diǎn)處理細(xì)胞,如何收集進(jìn)行蛋白提取更合理?
A

最好是收集完細(xì)胞后馬上進(jìn)行蛋白提取。


Q

濃度測(cè)定哪家強(qiáng)?
A

濃度測(cè)定方法很多,目前推薦使用兼容性較好的BCA法進(jìn)行濃度測(cè)定。


Q

蛋白樣品如何儲(chǔ)存?
A

蛋白樣品不建議久存,也不要反復(fù)凍融。下游做WB實(shí)驗(yàn),建議蛋白濃度測(cè)定后,加入loading buffer煮樣,煮后根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要分裝成小管在-80℃,下次使用前拿出小管再次煮樣即可。(


Q

樣品上樣前怎么處理?
A

蛋白濃度測(cè)定后,建議將各個(gè)樣品稀釋到某一固定濃度(稀釋可以PBS,水或裂解液),加入loading buffer后,在沸水中煮3-5分鐘,使蛋白充分變性,也可使用PCR儀95度加熱5分鐘。

PS:煮沸并非必須步驟,膜蛋白建議70℃或者更低溫度煮。

煮后在冰上靜置少許時(shí)間,進(jìn)行低速離心,即可上樣。


Q

組織樣品含血量多可以直接提蛋白嗎?
A

如組織樣品中含血較多,血紅蛋白可能會(huì)影響下游實(shí)驗(yàn), 可以在組織樣品裂解前使用紅細(xì)胞裂解液進(jìn)行處理后,再進(jìn)行蛋白提取。



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