蛋白質(zhì)組深度覆蓋分析(in-depth proteome)已成 為蛋白質(zhì)組學(xué)研究的發(fā)展趨勢, 通過大規(guī)模鑒定和 挖掘極低豐度的蛋白, 為信號通路、分子靶點和生物 標志物的研究提供重要信息. 然而, 由于全蛋白樣本 的復(fù)雜性, 蛋白質(zhì)組深度鑒定對色譜分離要求很高, 通常需要進行二維分離(強陰離子交換、高pH反相等), 或使用一維長梯度分離, 以降低高豐度蛋白的干擾 [1,2] . 但這樣消耗了大量時間, 重現(xiàn)性也不佳, 成為蛋 白質(zhì)組深度覆蓋研究的瓶頸. 

靜電場軌道阱(orbitrap)質(zhì)量分析器具有超高分 辨率、超高靈敏度等特點, 有效推動了蛋白質(zhì)組學(xué)的 發(fā)展[3,4] . 新型 Q-OT-qIT(Orbitrap Fusion)質(zhì)譜系統(tǒng)將四極桿(quadrupole, Q)、靜電場軌道阱(orbitrap, OT)和線性離子阱(linear quadrupole ion trap, qIT) 3 種 質(zhì)量分析器集為一體, 利用動態(tài)掃描管理技術(shù), 實現(xiàn) 了 3 種質(zhì)量分析器同時工作并相互協(xié)作, 一級、二級 掃描同時進行, 使分析效率達到大化[5] . Hebert 等 人[6]利用 Q-OT-qIT 質(zhì)譜, 5 次重復(fù)實驗, 在 70 min 有 效梯度下鑒定到約 4000 個酵母蛋白, 同樣的結(jié)果, 目前的文獻報道至少需要 4 h, 分析效率(單位時間蛋 白鑒定數(shù)量)提高了 4 倍以上[7,8] . 基于此, Hebert 等 人[6]提出“一小時酵母蛋白質(zhì)組”的概念, 即 1 h 左右的短梯度實現(xiàn)酵母蛋白質(zhì)組深度覆蓋. 蛋白質(zhì) 組學(xué)已進入新的時代.