樣本間交叉污染

主要是在采（?。拥倪^(guò)程中，由于取樣工具之間的交叉造成污染；或者在核酸提取的過(guò)程中，由于移液器、離心管等使用不當(dāng)導(dǎo)致的污染。 

PCR試劑的污染

主要是在PCR試劑配制過(guò)程中，由于移液器、容器、陰性對(duì)照及其它試劑被核酸模板或陽(yáng)性對(duì)照污染。

克隆質(zhì)粒的污染

在實(shí)驗(yàn)室操作中經(jīng)常會(huì)用到陽(yáng)性參考品，這些陽(yáng)性參考品大多數(shù)是由某些克隆質(zhì)粒制作而成，克隆質(zhì)粒在單位容積內(nèi)濃度高，不小心使用極易造成污染。

PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染

這是PCR反應(yīng)中主要常見(jiàn)的污染問(wèn)題。因?yàn)镻CR產(chǎn)物拷貝量大，遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于PCR檢測(cè)數(shù)個(gè)拷貝的極限，所以極微量的PCR產(chǎn)物污染，就可造成假陽(yáng)性結(jié)果。還有一種容易忽視，可能造成PCR產(chǎn)物污染的形式是氣溶膠污染，在空氣與液體面摩擦?xí)r就可形成氣溶膠，據(jù)計(jì)算一個(gè)氣溶膠顆?？珊?.8萬(wàn)拷貝，因而由其造成的污染是一個(gè)值得特別重視的問(wèn)題。