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賽默飛q5熒光定量pcr儀操作規(guī)程

2024-12-27  閱讀(82)

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賽默飛 QuantStudio Q5 熒光定量PCR儀操作規(guī)程

以下是 賽默飛 QuantStudio Q5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀 的標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程(SOP)。此規(guī)程涵蓋實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備、儀器操作、實(shí)驗(yàn)設(shè)置、運(yùn)行和數(shù)據(jù)分析的步驟。


1. 實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備

1.1 儀器檢查

  1. 確保儀器接通電源并處于正常工作狀態(tài)。

  2. 打開 QuantStudio Q5 儀器和配套的軟件系統(tǒng)。

  3. 檢查儀器光學(xué)模塊是否清潔,無塵無污染。

  4. 確認(rèn)實(shí)驗(yàn)室環(huán)境穩(wěn)定(溫度20-25°C,濕度40-60%),避免灰塵干擾。

1.2 反應(yīng)材料準(zhǔn)備

準(zhǔn)備 PCR 反應(yīng)所需試劑和耗材:

  • 樣本模板(DNA 或 RNA 轉(zhuǎn)錄的 cDNA)。

  • 引物和探針(根據(jù)靶標(biāo)基因設(shè)計(jì))。

  • 熒光定量PCR試劑(如SYBR Green Master Mix或TaqMan Master Mix)。

  • 96 孔板或 0.2 mL PCR 管,以及光學(xué)透明封板或封膜。

  • 無菌移液器、濾芯吸頭。

1.3 標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系

以下是 20 µL 體系的標(biāo)準(zhǔn)配方示例:

成分體積(µL)說明
PCR Master Mix10含有聚合酶、dNTP、Mg2?等
上下游引物(10 µM)0.5 各根據(jù)靶基因調(diào)整濃度
探針(10 µM)或染料0.5如 TaqMan 探針或 SYBR Green
模板 DNA/cDNA1-2根據(jù)樣本濃度調(diào)整體積
無核酸酶水至 20 µL補(bǔ)足總反應(yīng)體系體積

1.4 注意事項(xiàng)

  1. 反應(yīng)體系混合時(shí)保持在冰上操作。

  2. 混勻后輕微離心,避免產(chǎn)生氣泡。

  3. 使用負(fù)對(duì)照(無模板對(duì)照)和正對(duì)照,確保實(shí)驗(yàn)的可靠性。


2. 儀器操作步驟

2.1 啟動(dòng)儀器

  1. 打開 QuantStudio Q5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀。

  2. 啟動(dòng)配套軟件(QuantStudio Design and Analysis Software)。

  3. 選擇“新建實(shí)驗(yàn)"以創(chuàng)建實(shí)驗(yàn)文件。

2.2 實(shí)驗(yàn)參數(shù)設(shè)置

  1. 實(shí)驗(yàn)類型選擇:

    • 絕對(duì)定量:用于計(jì)算 DNA 或 RNA 的絕對(duì)拷貝數(shù)。

    • 相對(duì)定量:用于基因表達(dá)水平比較。

    • 溶解曲線分析:檢查 PCR 產(chǎn)物的特異性。

    • 基因分型:分析基因突變和 SNP。

  2. 板型設(shè)置:

    • 根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求選擇 96 孔或 384 孔板格式。

    • 為每個(gè)孔輸入樣本名稱(如標(biāo)準(zhǔn)品、未知樣本、對(duì)照組)。

  3. 熒光染料設(shè)置:

    • 根據(jù)使用的染料或探針設(shè)置相應(yīng)的熒光通道(如 FAM、VIC、ROX)。

    • 啟用 ROX 參考染料(如果試劑中包含)。

  4. 熱循環(huán)程序:

    • 初始變性:95°C,2-10 分鐘。

    • 循環(huán)反應(yīng)(40 次循環(huán))

    • 95°C,15 秒(變性)。

    • 60°C,30-60 秒(退火和延伸,熒光信號(hào)采集階段)。

    • 設(shè)置標(biāo)準(zhǔn) PCR 循環(huán)程序:

    • 如果需要溶解曲線分析,加入升溫梯度(如從 60°C 至 95°C)。

2.3 加載樣本板

  1. 將已封裝好的 PCR 板或管放入樣本托盤。

  2. 確保 PCR 板放置平穩(wěn),并封膜牢固,避免蒸發(fā)。

  3. 關(guān)閉樣本艙門,確保儀器密封。

2.4 啟動(dòng)實(shí)驗(yàn)

  1. 檢查設(shè)置無誤后,點(diǎn)擊 “運(yùn)行實(shí)驗(yàn)"。

  2. 儀器開始運(yùn)行,同時(shí)采集熒光信號(hào)。

  3. 在運(yùn)行過程中,實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)擴(kuò)增曲線以確認(rèn)擴(kuò)增反應(yīng)正常。


3. 數(shù)據(jù)分析

3.1 實(shí)時(shí)監(jiān)控

  • 儀器運(yùn)行時(shí),軟件界面會(huì)顯示擴(kuò)增曲線的實(shí)時(shí)變化。

  • 檢查所有樣本的熒光信號(hào)是否正常累積。

3.2 Ct 值分析

  • Ct 值(循環(huán)閾值): 自動(dòng)計(jì)算每個(gè)樣本的 Ct 值,Ct 值越低,樣本初始濃度越高。

  • 對(duì)照標(biāo)準(zhǔn)品生成標(biāo)準(zhǔn)曲線,用于絕對(duì)定量計(jì)算樣本濃度。

3.3 溶解曲線分析(SYBR Green 實(shí)驗(yàn))

  • 檢查 PCR 產(chǎn)物是否特異性擴(kuò)增。

  • 特異性擴(kuò)增應(yīng)顯示單一峰值,非特異性產(chǎn)物會(huì)有多個(gè)峰值。

3.4 數(shù)據(jù)導(dǎo)出

  • 將分析結(jié)果(擴(kuò)增曲線、Ct 值表、溶解曲線等)保存為 Excel、PDF 或圖片格式。

  • 確保實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)備份并存檔。


4. 實(shí)驗(yàn)完成后的維護(hù)

4.1 清潔儀器

  1. 實(shí)驗(yàn)完成后,取出樣本板并清理托盤。

  2. 用無塵布輕輕擦拭儀器內(nèi)部,防止樣本殘留。

4.2 光學(xué)模塊維護(hù)

  • 定期清潔光學(xué)模塊,保持熒光檢測(cè)的靈敏度。

  • 如果出現(xiàn)熒光信號(hào)異常,需校準(zhǔn)光學(xué)模塊。

4.3 溫控校準(zhǔn)

  • 按照儀器使用手冊(cè),每 3-6 個(gè)月對(duì)溫控模塊進(jìn)行校準(zhǔn),確保溫度一致性。

4.4 軟件更新

  • 定期檢查軟件版本,安裝賽默飛發(fā)布的最新補(bǔ)丁或更新。


5. 注意事項(xiàng)

  1. 樣本操作

    • 使用無核酸酶污染的耗材和移液器。

    • 避免模板 DNA 交叉污染。

  2. 試劑保存

    • 熒光染料和酶類應(yīng)按照試劑說明存放(如 -20°C 冷凍)。

    • 使用前確保試劑混勻。

  3. 實(shí)驗(yàn)運(yùn)行

    • 在運(yùn)行過程中不要隨意中斷儀器運(yùn)行,防止數(shù)據(jù)丟失。

    • 若出現(xiàn)異常終止,記錄故障代碼并聯(lián)系賽默飛技術(shù)支持。


總結(jié)

賽默飛 QuantStudio Q5 熒光定量PCR儀以其靈活性和高精度著稱,是中小型實(shí)驗(yàn)室開展基因定量分析的理想工具。嚴(yán)格按照操作規(guī)程(SOP)進(jìn)行實(shí)驗(yàn),可提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性和可重復(fù)性,同時(shí)確保儀器的長(zhǎng)期穩(wěn)定運(yùn)行。



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