目錄:上海烜雅生物科技有限公司>>分子生物學試劑>>試劑盒>> 隨機引物法 DNA 探針標記試劑盒
供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 規(guī)格 | 5次 |
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貨號 | XY-D-1744 | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 化工,生物產(chǎn)業(yè) |
主要用途 | 科研 | 英文名稱 | / |
保存條件 | -20℃ | 有效期 | 1年 |
產(chǎn)品簡介:
本產(chǎn)品是基于Feinberg 和Vogelstein 發(fā)明的隨機引物標記法而開發(fā)出來的即用型 DNA 探針標記試劑盒,標記過程由雙鏈 DNA 熱變性、隨機引物與單鏈 DNA 結(jié)合、在 Klenow DNA 聚合酶催化下,引物的延伸合成 DNA 探針并摻入標記的核苷酸三步組成,可用下面的示意圖表示:
產(chǎn)品特點:
1.提供的標記反應(yīng)液整合了除酶和模板外的所有成分,簡化了反應(yīng)加樣步驟,提高了標記反應(yīng)的可重復性。
2.使用無外切活性的 Klenow exo- DNA 聚合酶,已標記DNA 探針不會被酶降解,探針產(chǎn)量更高。
3.快速,最快 1 小時即可完成標記反應(yīng)。
4.得到的 DNA 探針比活性高(如果是同位素,可以達到 10E9 cpm/ug DNA)。
5.所需模版 DNA 量少,模板可以是線狀或環(huán)狀的、也可以是單鏈或雙鏈的,但長度必須在 100 bp 以上。
6.得到的探針長度一般在 200-400 nt 之間(如果模板長度在 1kb 以上),可以用于 Southern 雜交、Northern 雜交、原位雜交、菌落和斑點印跡雜交等。
7.本產(chǎn)品足夠 5 次標記實驗。
8.隨機引物法 DNA 探針標記試劑盒(自備標記核苷酸型)只能用于科研。
產(chǎn)品參數(shù):
成份 規(guī)格包裝
10×隨機引物標記反應(yīng)液10 μL0.5 mL 綠蓋管
(自備標記核苷酸型)
Klenow exo-聚合酶 5 μL0.5 mL 紅蓋管
dATP,2 mM 10μL0.5 mL 白蓋管
dTTP,2 mM 10μL0.5 mL 紫蓋管
dGTP,2 mM 10μL0.5 mL 藍蓋管
dCTP,2 mM 10μL0.5 mL 黃蓋管
標記專用隨機引物溶液 10μL0.5 mL 橙蓋管
超純水 1 mL1.5 mL 本色管
使用手冊 1 份無
運輸及保存
低溫運輸,-20℃保存,有效期一年。
自備試劑
0.5 M EDTA(pH 8.0),需要自備標記的核苷酸。
使用方法:
注意:隨機引物標記效率跟起始模板量和保溫時間相關(guān),雜交時需要探針 DNA 必須達到一定的濃度,其中探針/模板比越高,沒有標記的模板 DNA 對雜交的競爭性抑制越低。用戶在實驗前可以根據(jù)下表選擇合適的起始模板量和保溫時間:
1. 在一干凈的硅化的塑料離心管中加入下列成分:
成分用量
模板 DNA50-150 ng
隨機引物2 μL
10×隨機引物標記反應(yīng)液2 μL
超純水補水到 15 μL
注意:非同位素標記基團(如生物-素和地-高辛)疏水性強,易與塑料離心管表面非特異性結(jié)合,所以要硅化塑料離心管。模板 DNA 并非越多越好,否則沒有標記的模板 DNA 在雜交時會競爭性地抑制標記 DNA 跟靶分子的雜交,反而降低雜交信號強度。
2.沸水浴 10 分鐘,或在PCR 儀上 100℃加熱 10 分鐘徹-底變性模板 DNA,結(jié)束后需要立即放冰上待用。不能緩慢降溫,否則變性的模板 DNA 單鏈又會雜交形成雙鏈。
3.離心數(shù)秒使所有液體集中在管底,如果標記物為 dTTP 則加入除 dTTP 之外的三種核苷酸(dATP、dGTP、dCTP)各 1 μL(共 3 μL,濃度均為 2mM),自備的 dTTP/標記dUTP 混合物 1μL,最后加入 1 μL Klenow exo 聚合酶。如果標記物為 dCTP 則加入除 dCTP 之外的三種核苷酸(dATP、dGTP、dTTP)各 1 μL,以此類推。
注:dTTP/標記 dUTP 混合物中dTTP 和標記 dUTP 的總濃度必須達到2mM, dTTP 與生物-素標記dUTP 或地-高辛標記的 dUTP 的比例在 65:35 為最佳。但如果使用自備的其他標記核苷酸,如 fluorescein、hydroxycoumarin、 resorufin 和 aminoallyl 標記的 dUTP,則用戶需要自己摸索其與 dTTP 之間的最佳比例,如果使用 32P 標記的dUTP,則比活最好為 3000Ci/mmol,濃度為好為 10uCi/μL,并且不需要加入 dTTP。
4.輕柔吹打混勻。如有液滴沾在管壁上,離心數(shù)秒使所有液體集中在管底。
5.37℃保溫 1-20 小時。反應(yīng)結(jié)束后加熱 100℃ 5 分鐘使 DNA 聚合酶變性, 同時使 DNA 探針變性成單鏈,然后立即冰上冷凍。不能緩慢降溫,否則變性的模板 DNA 單鏈又會雜交形成雙鏈。
6.變性后的標記反應(yīng)液可以放-20℃長期保存,也可以直接加入到雜交反應(yīng)液中進行雜交。如果電泳檢測,標記產(chǎn)物將是彌散狀態(tài)。
注意:本方法標記核苷酸摻入率極-高,因此可以不經(jīng)純化直接使用。如果需要純化, 不要用酚抽提法純化非同位素標記的 DNA 探針,因為這些標記分子(如生物-素或地-高辛等)疏水性強,能使標記的 DNA 進入疏水的有機相而丟失。只能選擇乙醇直接沉淀或 Sephadex G50 過柱回收(需另購柱式探針純化試劑盒)。對比活高
的同位素標記探針,由于同位素其極其不穩(wěn)定,因此應(yīng)該立即使用,不要長久放置。
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