目錄:上海烜雅生物科技有限公司>>分子生物學(xué)試劑>>試劑盒>> AFLP 試劑盒(EcoRI-MseI)
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更新時(shí)間:2025-04-24 12:48:46瀏覽次數(shù):26評(píng)價(jià)
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供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 規(guī)格 | 1600次 |
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貨號(hào) | XY-D-1748 | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 化工,生物產(chǎn)業(yè) |
主要用途 | 科研 | 英文名稱 | AFLP Kit(EcoRI-MseI) |
保存條件 | -20℃ | 有效期 | 1年 |
產(chǎn)品簡(jiǎn)介:
AFLP(amplified fragment length polymorphism,擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性)原理是一種結(jié)合 RFLP 和 PCR 技術(shù)特點(diǎn)的一種分子標(biāo)記分型技術(shù),其原理如下:
產(chǎn)品特點(diǎn):
1.一站式,足夠 50 次酶切-連接反應(yīng)、50 次預(yù)擴(kuò)反應(yīng)和 1500 次 AFLP PCR(30 μL體系計(jì)算),但不包括 DNA 純化和帶型分析試劑(如 PAGE 電泳試劑和銀染試劑)
2.本產(chǎn)品提供 EcoRI-MseI 組合,適用于 GC 含量在 50%以上的基因組。對(duì) GC 含量在 50%以下的基因組,需從本公司另外采購(gòu) EcoRI-TaqI 組合的 AFLP 試劑盒。
3.各種參數(shù)都經(jīng)過(guò)優(yōu)化,一次 PCR 所得 AFLP 片段數(shù)一般在 10-100 之間,可重復(fù)性好,誤差小于 0.6%。
4.本產(chǎn)品適用于基因組在 500 Mb-6000 Mb 的材料(如動(dòng)物和植物)。對(duì)于基因組在 50-500 Mb 的材料(如細(xì)菌和真菌)或 50Mb 以下的材料(如質(zhì)粒,cosmid,BAC YAC 和 PAC 等),需要分別另購(gòu)+0 型預(yù)擴(kuò)增引物對(duì)和+2 型擴(kuò)增引物。
5.AFLP 試劑盒(EcoRI-MseI)只能用于科研。
產(chǎn)品參數(shù):
成份規(guī)格包裝
AFLP 酶切-連接-預(yù)擴(kuò)增相關(guān)成分50 次十孔盒
AFLP +3 型 EcoRI 引物系列8 條十孔盒
AFLP +3 型 MseI 引物系列8 條十孔盒
AFLP PCR 成分5 mL×6熱封塑料袋
使用手冊(cè)1 份無(wú)
運(yùn)輸及保存
低溫運(yùn)輸、-20℃保存,有效期一年。
自備試劑
超純水、Southern 級(jí) DNA 純化試劑,尿素-PAGE 電泳套裝,銀染試劑盒。
使用方法:
一、 DNA 提?。ū驹噭┖胁惶峁┫嚓P(guān)試劑)
1.用戶需要自備 50-500ng Southern 級(jí)別的基因組 DNA。DNA 酶切徹-底是 AFLP 成功的關(guān)鍵,所以最好先預(yù)實(shí)驗(yàn)以確保 DNA 能夠被 EcoRI 和 MseI 內(nèi)切酶徹-底切開。
二、 限制性內(nèi)切酶酶切和 DNA-接頭連接反應(yīng)(本試劑盒足夠 50 次 20μL 體系的酶切-
連接反應(yīng))
2.在 0.2mL 離心管中設(shè)置 20μL 的限制性內(nèi)切酶酶切反應(yīng):
3.輕柔混勻并短暫離心后,37℃保溫 2 小時(shí)酶切(若 PCR 儀器不帶熱蓋,則必須加 50?L自備石蠟油,否則水分會(huì)蒸發(fā)影響反應(yīng)。下同)。反應(yīng)結(jié)束后 70℃保溫 15 分鐘滅活酶。
4.在體系中加入 20μL AFLP EcoRI-MseI 接頭混合物和 1μL T4 DNA 連接酶,5U/?L,輕柔混勻并短暫離心,20℃保溫 3 小時(shí)讓接頭跟酶切 DNA 片段連接。第一次使用本試劑盒時(shí),需要把本試劑盒提供的 1mL AFLP EcoRI-MseI 接頭溶解液加入到 AFLP EcoRI-MseI 接頭干粉管,渦旋震蕩半分鐘,短暫離心,然后再取用。沒有用完的需要放-20℃保存。
5.反應(yīng)結(jié)束后直接在 40μL 的連接反應(yīng)體系中加入自備 360μL 超純水,得到連接液 10倍稀釋液,直接作為模板用于下步的預(yù)擴(kuò)增或放-20℃保存待用。
三、 預(yù)擴(kuò)增(本試劑盒足夠 40 次 30μL 體系的預(yù)擴(kuò)增反應(yīng))
6.在 0.2mL 離心管中設(shè)置 30μL 的預(yù)擴(kuò) PCR 體系。首-次使用本試劑盒時(shí),需要在本試
劑盒提供的+1 型 EcoRI-MseI 預(yù)擴(kuò)增引物干粉管中加入 100μL 自備超純水,渦旋震
蕩半分鐘混勻,短暫離心后直接取用。沒有用完的部分,需要放-20℃保存:
7.離心數(shù)秒,按下列參數(shù)進(jìn)行 PCR 預(yù)擴(kuò)增(注意:第一步是預(yù)合成,跟常規(guī) PCR 不同):預(yù)合成 72℃ 2 分鐘,PCR 循環(huán) 20 次(94℃30S,56℃60S,72℃60S)
8.取 10μL PCR 產(chǎn)物在 1.5%瓊脂糖膠上電泳檢測(cè),產(chǎn)物應(yīng)為大小在 100-1500bp 的模糊條帶。本試劑盒的 2×PCR MasterMix 含上樣液和示蹤染料,故不需要額外加 Loading Buffer。示蹤染料的泳動(dòng)速度相當(dāng)于 50bp 的 DNA 片段。
9.在剩下的 20μL 預(yù)擴(kuò)增反應(yīng)液中加入 980μL 自備超純水,相當(dāng)于稀釋 50 倍,所得 50倍 PCR 模板稀釋液將直接作為模板用于下步擴(kuò)增或放-20℃保存待用。
四、選擇性 PCR 擴(kuò)增
10.制備引物:在本試劑盒提供的 8 只+3 型 EcoRI 引物干粉和 8 只+3 型 MseI 引物干粉中,每管分別加入 1100μL 自備超純水,震蕩混勻得 16 管引物母液。每管取 66μL引物母液與 1034μL 超純水在 1.5mL 離心管中混合得 1100μL 每個(gè)引物的相應(yīng)工作液,共 16 管引物工作液。
11.在 0.2 mL PCR 管中,加入下列成分(第一次 PCR 時(shí)需要測(cè)試所有 8×8=64 種引物組合,需設(shè)置 64 個(gè) PCR 反應(yīng)。若已知哪個(gè)一種或幾種引物組合適合,則可以直接使用選中的引物),下面以一種+3 型 EcoR I 引物和+3 型 Mse I 引物組合為例:
12.輕柔混勻后離心數(shù)秒,按下列參數(shù)進(jìn)行 PCR:
溫度時(shí)間
PCR
13 次循環(huán)94℃30 秒
65℃30 秒(每次循環(huán)遞減 0.7℃)
72℃60 秒
PCR
23 次循環(huán)94℃30 秒
55℃30 秒
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