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Label free實(shí)驗(yàn)
Label free: 非標(biāo)定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù);
比如你有10個(gè)組織樣品,分別提取蛋白質(zhì)并酶解成肽段。然后每一個(gè)肽段樣品進(jìn)行LC-MS分析,這樣就得到10個(gè)MS數(shù)據(jù);
對于1條肽段,其在10個(gè)樣品中的豐度(量)與其在MS1中的峰面積或信號強(qiáng)度成正比;
理論上,對于10個(gè)樣品中的同一條肽段,其在LC上的保留時(shí)間(retention time, RT)是一致的,因此,可以通過對比MS圖譜,實(shí)現(xiàn)對蛋白質(zhì)在不同樣本中的相對表達(dá)水平的定量分析。
Label free實(shí)驗(yàn)技術(shù)特色:
1、與SILAC, iTRAQ/TMT技術(shù)相比,樣品無需標(biāo)記,能終程度地保留樣品的“真實(shí)性”;
2、樣品處理步驟簡單,蛋白質(zhì)只需酶解即可進(jìn)行LC-MS分析;
3、能很大程度的節(jié)省樣本制備費(fèi)用。
Label free分析軟件
Maxquant,Progenesis 等。
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