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生物信息學(xué)分析實驗
生物信息學(xué)(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、處理、存儲、傳播,分析和解釋等各方面的學(xué)科,也是隨著生命科學(xué)和計算機科學(xué)的迅猛發(fā)展,生命科學(xué)和計算機科學(xué)相結(jié)合形成的一門新學(xué)科。它通過綜合利用生物學(xué),計算機科學(xué)和信息技術(shù)而揭示大量而復(fù)雜的生物數(shù)據(jù)所賦有的生物學(xué)奧秘。
生物信息學(xué)分析實驗服務(wù)流程
1、客戶提供研究方向
2、生信工程師提供分析提綱
3、反饋溝通
4、進行數(shù)據(jù)分析
5、出具分析報告
三、研究案例展示(芯片分析)
研究背景:
肝癌可以分為三種類型:肝細胞癌、膽管細胞性肝癌和混合性肝癌。本研究的目的是為了尋找這三種肝癌基因表達情況的不同點和相同點。
研究策略:
1、從NCBI GEO數(shù)據(jù)庫中下載轉(zhuǎn)錄表達譜,包括70張肝細胞癌芯片,13張膽管細胞性肝癌芯片和7張混合性肝癌芯片。
2、對三種類型的肝癌進行兩兩比較,尋找差異基因。
3、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,聚類分析,MCODE分析,GSEA富集分析。
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