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一、轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒?/strong>產(chǎn)品介紹
轉(zhuǎn)錄組測序(Transcriptome sequencing)是通過二代測序平臺快速地獲得某一物種特定細胞或組織在某一狀態(tài)下的的轉(zhuǎn)錄本及基因序列,可以用于研究基因表達量、基因功能、結構、可變剪接和新轉(zhuǎn)錄本預測等。目前,轉(zhuǎn)錄組測序已經(jīng)被廣泛應用于基礎研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領域。上海劍鈍生物利用標準化的實驗流程、先進的測序平臺和專業(yè)的信息分析,以高效率、高質(zhì)量的科技服務贏得業(yè)內(nèi)專業(yè)人士的良好口碑。
二、樣品要求
1)樣品類型:細胞、新鮮組織或RNA樣品。
2)樣品的量:細胞樣品請?zhí)峁┲辽?×107個細胞,組織樣品請?zhí)峁┲辽?00mg的組織塊或切片,RNA樣品請?zhí)峁?0μg以上的總RNA。
3)樣品質(zhì)量:RNA無明顯降解,提取的總RNA OD260/280值在1.8~2.2之間,濃度 ≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 8。
4)樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)可用TRIZOL或RNA保護劑處理或液氮凍存后,-80℃保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存。樣品保存期間避免反復凍融。
5)樣品運輸:樣品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運輸。
三、轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒?/strong>操作流程
1. 全轉(zhuǎn)錄組總RNA提??;
2. mRNA分離和文庫構建;
3. 高通量測序;
4. 數(shù)據(jù)處理與生物信息學分析;
5. 測序報告生成
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