博思公司的農博士育種家軟件(NBSbreeding)一直在開發(fā)完善更實用更有價值的軟件功能,服務眾多軟件用戶。繼自主成功開發(fā)BLUP育種值(breeding value)線性混合模型分析方法后,前段時間又進一步推出了REML方差組分估計功能,剛剛過去的70周年國慶,博思公司技術人員一直在工作崗位加班加點,不負眾望,( BLUP AB群育種)(GCA)功能開發(fā)成功。
農博士育種家軟件(NBSbreeding)不斷完善自身功能,我們寫文章建議植物育種領域要重視育種值應用,用育種值提升一般配合力分析水平,是考慮,植物育種在數(shù)據(jù)分析領域需要向動物育種借鑒成熟的數(shù)學分析方法。作為一款專業(yè)的植物育種軟件,我們也會把BLUP跟一般配合力(GCA)結合的線性混合模型分析技術開發(fā)出來給軟件用戶使用。我們會推薦建議,但我們一定提供給用戶多樣選擇。我們就是為育種用戶服務的。
配合力的計算如果按照配合力公式,真是小學生都可以完成的計算,過于簡單了。所以一直猜測,種業(yè)大公司不會這樣簡單的使用配合力,這不,一種復雜的BLUP 配合力分析模型就來了。
本功能開發(fā),參考了美國明尼蘇達大學 RexBernardo教授1996年前后發(fā)表的BLUP線性混合模型玉米育種應用系列文章,也參考了王健康老師的《應用數(shù)量遺傳》第二版教材,在此一并致謝。BLUP AB群育種,這個功能命名,主要是明確該BLUP分析功能,是服務于AB群(SS-NSS)育種模式使用的,比如采用SS-NSS思路模式進行的玉米育種,同時該功能*可以應用于類似模式育種的其他作物領域,并不于玉米育種。
功能使用操作簡單,選擇試驗數(shù)據(jù),對試驗材料相關親本AB群,就可以進行BLUP線性混合模型分析了。
Rex Bernardo教授采用的模型:
y = Xβ+ Z0c+ Z1g1 + Z2g2 + Zd + e
王健康老師采用的模型
y = Xβ+ Ug1+ Wg2 + Zs + e
農博士育種家軟件(NBSbreeding)采用的模型
y =μ+ Xβ+ Ua + Wb + Zs + e
μ:試驗數(shù)據(jù)均值
β:年度+地點的合并固定效應
a:A群一般配合力向量
b:B群一般配合力向量
s:測配組合A×B特殊配合力向量
e:剩余誤差向量
X、U、W、Z為相應關聯(lián)矩陣。
我們根據(jù)植物育種特點,結合植物育種數(shù)據(jù)特點,改造擴展了數(shù)學模型,更適合AB群模式育種使用。
BLUP AB群育種使用建議:
在測配組合結果分析時使用,或者配合力試驗直接用該功能分析。
給育種者帶來的幫助有:
1、計算出試驗中親本材料的一般配合力效應值。據(jù)此可以清楚看出親本的育種價值。
2、計算出測配組合的特殊配合力效應值。對篩選組合有指導價值。
3、利用已測試組合來推斷未測試組合的各種效應值,有希望發(fā)現(xiàn)更好的未測配材料組合,對減少育種成本,降低測配工作任務量有積極意義。
NBSbreeding育種家軟件中BLUP線性混合模型有3種應用可供用戶選用:
分別是,
BLUP育種值
REML方差組分估計
BLUP AB群育種
BLUP育種值是基于育種值(breeding value)的BLUP線性混合模型分析方法,而BLUP AB群育種是基于一般配合力(GCA)。關于這兩種分析方法的區(qū)別和聯(lián)系,請參照博思公司發(fā)布的相關技術資料。
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