細(xì)胞STR鑒定

細(xì)胞STR鑒定應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域的哺乳動(dòng)物細(xì)胞被錯(cuò)誤鑒定和交叉污染的問(wèn)題，一直是一個(gè)普遍存在的突出問(wèn)題。

據(jù)統(tǒng)計(jì)，國(guó)外實(shí)驗(yàn)室有20%左右的細(xì)胞株被錯(cuò)誤鑒定和交叉污染，NIH和ATCC近兩年都對(duì)此發(fā)出呼吁，要求研究者對(duì)細(xì)胞進(jìn)行鑒定。近年來(lái)，大量研究表明STR基因分型方法是進(jìn)行細(xì)胞交叉污染和性質(zhì)鑒定的效和準(zhǔn)確的方法之一，STR基因分型應(yīng)用于細(xì)胞鑒定已被ATCC等機(jī)構(gòu)強(qiáng)烈推薦。美國(guó)的ATCC細(xì)胞庫(kù)、德國(guó)的DSMZ細(xì)胞庫(kù)以及日本的JCRB細(xì)胞庫(kù)等為STR分型提供了各細(xì)胞株的數(shù)據(jù)供比對(duì)。

STR（Short Tandem Repeat，短串聯(lián)重復(fù)序列）基因位點(diǎn)由長(zhǎng)度為3-7個(gè)堿基對(duì)的短串連重復(fù)序列組成，這些重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中，可作為高度多態(tài)性標(biāo)記，被稱為細(xì)胞的DNA指紋，其可通過(guò)PCR（聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)）來(lái)檢測(cè)。STR基因座位上的等位基因可通過(guò)擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來(lái)區(qū)分，在毛細(xì)管電泳分離之后可通過(guò)熒光檢測(cè)來(lái)識(shí)別。隨后通過(guò)一定的計(jì)算方法，即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與專業(yè)的細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。

細(xì)胞STR鑒定服務(wù)流程：

細(xì)胞STR鑒定樣本要求：

細(xì)胞系錯(cuò)誤鑒定所造成的后果：

★ 細(xì)胞系的損失；

★ 時(shí)間和金錢的損失；

★ 在公眾領(lǐng)域（文獻(xiàn)、等）提供錯(cuò)誤信息；

★ 造成實(shí)驗(yàn)結(jié)果不一致或不可重復(fù)；

★ ……

何時(shí)需做細(xì)胞STR鑒定？

1、發(fā)表文章或申請(qǐng)課題經(jīng)費(fèi)前；

2、使用細(xì)胞進(jìn)行臨床治療（試驗(yàn)）前；

3、準(zhǔn)備凍存保種或已凍存多年的細(xì)胞；

4、一個(gè)涉及到細(xì)胞試驗(yàn)項(xiàng)目開(kāi)始/結(jié)束時(shí)；

5、新得到的細(xì)胞或?qū)嶒?yàn)室傳5代以上的細(xì)胞；

6、細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大。

已開(kāi)始要求細(xì)胞鑒定的期刊：

★ Nature

★ BioTechniques

★ Cancer Research

★ Cancer Discovery

★ Clinical Cancer Research

★ Molecular Cancer Research

★ Cancer Prevention Research

★ International Journal of Cancer

★ Molecular Cancer Therapeutics

★ Cell Biochemistry and Biophysics

★ Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention

★ In Vitro Cellular & Developmental Biology - Animal

★ ......

人源細(xì)胞STR位點(diǎn)信息：

為進(jìn)一步提高鑒定的分辨率，除了包含ATCC檢測(cè)的8個(gè)STR和1個(gè)性別決定位點(diǎn)Amelogenin外，另新增了12個(gè)高度多態(tài)性位點(diǎn)，共檢測(cè)21個(gè)STR位點(diǎn)。