賽默飛實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀ViiA 7工作原理
賽默飛實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀ViiA 7(Applied Biosystems)是一款專為實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qPCR)設(shè)計(jì)的設(shè)備。它廣泛應(yīng)用于基因表達(dá)分析、基因突變檢測、微生物鑒定、病毒檢測等領(lǐng)域。ViiA 7能夠通過實(shí)時(shí)監(jiān)測PCR反應(yīng)中的熒光信號(hào)變化,準(zhǔn)確地提供樣品中目標(biāo)基因的初始拷貝數(shù)。本文將詳細(xì)介紹ViiA 7實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀的工作原理、特點(diǎn)、應(yīng)用以及優(yōu)勢。
1. 實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)概述
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)(qPCR)是一種能夠在PCR反應(yīng)過程中實(shí)時(shí)監(jiān)測擴(kuò)增過程的方法。與傳統(tǒng)的PCR技術(shù)不同,qPCR通過熒光探針或染料在每個(gè)擴(kuò)增循環(huán)中釋放的熒光信號(hào)來定量分析DNA樣本的初始量。PCR反應(yīng)利用特定的引物和探針,在溫度變化的循環(huán)中對目標(biāo)DNA進(jìn)行擴(kuò)增,并通過熒光信號(hào)強(qiáng)度的變化監(jiān)測擴(kuò)增進(jìn)程,從而定量初始模板。
傳統(tǒng)PCR需要在反應(yīng)結(jié)束后通過凝膠電泳等方法才能分析結(jié)果,而qPCR通過實(shí)時(shí)測量擴(kuò)增過程中熒光信號(hào)的變化,提供了高靈敏度和高通量的定量信息。
2. ViiA 7實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀工作原理
ViiA 7實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀的工作原理基于熒光信號(hào)的檢測。其核心過程包括模板DNA的擴(kuò)增、熒光信號(hào)的采集和數(shù)據(jù)分析。以下是ViiA 7工作原理的詳細(xì)步驟:
2.1 PCR反應(yīng)過程
實(shí)時(shí)PCR過程包含三個(gè)主要步驟:變性、退火和延伸。在每個(gè)循環(huán)中,ViiA 7都會(huì)實(shí)時(shí)記錄熒光信號(hào)的變化,隨著PCR反應(yīng)的進(jìn)行,信號(hào)強(qiáng)度會(huì)增加。這一過程具體如下:
變性:在高溫下,DNA雙鏈分離為單鏈。
退火:溫度下降,引物與模板DNA結(jié)合,形成DNA-引物復(fù)合物。
延伸:在適宜的溫度下,DNA聚合酶根據(jù)模板DNA合成新的DNA鏈。
隨著反應(yīng)的進(jìn)行,目標(biāo)DNA數(shù)量的不斷增加,熒光信號(hào)也會(huì)逐漸增強(qiáng)。ViiA 7系統(tǒng)通過熒光信號(hào)的變化,來計(jì)算樣品中目標(biāo)基因的初始拷貝數(shù)。
2.2 熒光信號(hào)檢測
ViiA 7使用高靈敏度的熒光探測系統(tǒng),能夠在每個(gè)PCR循環(huán)結(jié)束時(shí)實(shí)時(shí)采集熒光信號(hào)。熒光探針或染料在擴(kuò)增過程中與特定的DNA序列結(jié)合,產(chǎn)生熒光。ViiA 7可以使用不同類型的熒光染料和探針,如SYBR Green、TaqMan探針等。
SYBR Green:一種常用的熒光染料,能夠結(jié)合雙鏈DNA并在激發(fā)光照射下發(fā)射熒光。由于其非特異性結(jié)合方式,它適用于所有類型的目標(biāo)序列。
TaqMan探針:是一種具有熒光標(biāo)記的探針,其通過與目標(biāo)DNA的特異性結(jié)合,在擴(kuò)增過程中產(chǎn)生熒光信號(hào)。
每個(gè)熒光信號(hào)的強(qiáng)度與PCR產(chǎn)物的數(shù)量成正比,因此可以通過熒光信號(hào)的變化來定量目標(biāo)DNA。
2.3 熒光信號(hào)與CT值的關(guān)系
在qPCR實(shí)驗(yàn)中,檢測到的熒光信號(hào)會(huì)隨著每個(gè)循環(huán)的進(jìn)行而增加。實(shí)驗(yàn)通常使用CT(閾值周期)值來表示熒光信號(hào)明顯超過背景噪音的周期數(shù)。CT值越低,表示樣品中目標(biāo)基因的初始拷貝數(shù)越多。
ViiA 7通過精確計(jì)算CT值和樣品中目標(biāo)DNA的標(biāo)準(zhǔn)曲線,能夠進(jìn)行定量分析。標(biāo)準(zhǔn)曲線通常由一系列已知濃度的模板DNA構(gòu)建,通過比較樣品的CT值與標(biāo)準(zhǔn)曲線的對應(yīng)關(guān)系,最終可以計(jì)算出目標(biāo)基因的初始拷貝數(shù)。
2.4 多重PCR和多重?zé)晒鈾z測
ViiA 7支持多重PCR技術(shù),即同時(shí)檢測多個(gè)目標(biāo)基因。通過使用不同波長的熒光標(biāo)記物,可以在一個(gè)反應(yīng)中同時(shí)檢測多個(gè)基因的擴(kuò)增。每個(gè)熒光染料或探針與特定的目標(biāo)基因結(jié)合,通過不同的熒光信號(hào)進(jìn)行區(qū)分。這種多重PCR技術(shù)在高通量篩選和基因表達(dá)分析中非常有用。
3. ViiA 7實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀的主要特點(diǎn)
ViiA 7實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀具有多項(xiàng)創(chuàng)新技術(shù)優(yōu)勢,使其成為科研和臨床實(shí)驗(yàn)中非??煽康墓ぞ?。以下是ViiA 7的一些主要特點(diǎn):
3.1 高靈敏度和高分辨率
ViiA 7采用了先進(jìn)的熒光探測系統(tǒng),具有靈敏度和分辨率,能夠檢測到極低濃度的目標(biāo)DNA。其精準(zhǔn)的熒光信號(hào)采集能力,確保了實(shí)驗(yàn)結(jié)果的高可靠性和重復(fù)性。
3.2 精確的溫控系統(tǒng)
ViiA 7配備了精確的溫控系統(tǒng),能夠精確控制PCR反應(yīng)的溫度變化,確保每個(gè)擴(kuò)增循環(huán)的準(zhǔn)確執(zhí)行。這對于復(fù)雜的基因擴(kuò)增和多重PCR反應(yīng)尤為重要。
3.3 靈活的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和自動(dòng)化分析
ViiA 7的用戶界面簡潔直觀,支持靈活的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。通過軟件,用戶可以根據(jù)需要設(shè)定PCR反應(yīng)的條件,選擇合適的熒光染料或探針。此外,ViiA 7配備了自動(dòng)化分析工具,可以自動(dòng)進(jìn)行數(shù)據(jù)處理和結(jié)果分析,極大地提高了實(shí)驗(yàn)效率。
3.4 多樣的檢測模式
ViiA 7支持多種檢測模式,包括SYBR Green染料法、TaqMan探針法和多重PCR檢測,用戶可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求選擇合適的模式。這些模式的結(jié)合,使得ViiA 7在基因表達(dá)分析、基因突變檢測和病原微生物檢測等多個(gè)領(lǐng)域具有廣泛應(yīng)用。
3.5 良好的數(shù)據(jù)管理和可視化功能
ViiA 7配備了強(qiáng)大的數(shù)據(jù)管理和可視化功能,用戶可以方便地查看實(shí)驗(yàn)結(jié)果、生成報(bào)告并進(jìn)行數(shù)據(jù)存儲(chǔ)。其內(nèi)置的分析軟件能夠提供詳細(xì)的CT值、標(biāo)準(zhǔn)曲線、效率分析等信息,并支持與其他實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的比較。
4. ViiA 7的應(yīng)用領(lǐng)域
ViiA 7在多個(gè)領(lǐng)域都有廣泛的應(yīng)用,特別是在基因表達(dá)分析、病毒檢測、基因突變篩查等方面具有重要意義。
4.1 基因表達(dá)分析
ViiA 7廣泛應(yīng)用于基因表達(dá)定量分析,研究人員通過實(shí)時(shí)qPCR技術(shù),能夠監(jiān)測不同條件下基因的表達(dá)變化。這對于研究基因調(diào)控機(jī)制、篩選藥物靶點(diǎn)、分析疾病相關(guān)基因等具有重要意義。
4.2 病毒檢測
ViiA 7可用于病毒的定量檢測,特別是在臨床檢測中,如新冠病毒檢測、HIV病毒檢測、乙肝病毒檢測等。實(shí)時(shí)qPCR技術(shù)能夠在病毒量極低時(shí)準(zhǔn)確檢測,并且能夠快速出具檢測結(jié)果。
4.3 基因突變檢測
ViiA 7可用于檢測基因突變,尤其是單核苷酸多態(tài)性(SNP)和插入/缺失(Indel)變異。通過設(shè)計(jì)特異性探針,可以快速準(zhǔn)確地識(shí)別和定量突變的存在。
4.4 微生物檢測
ViiA 7還可以用于微生物檢測,如細(xì)菌、真菌等病原微生物的定量分析。通過實(shí)時(shí)PCR技術(shù),能夠在樣本中快速檢測到微生物的存在,并對其進(jìn)行定量分析。
5. 總結(jié)
賽默飛ViiA 7實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀是一款高性能的PCR分析工具,具有靈敏度高、溫控精確、實(shí)驗(yàn)靈活等優(yōu)點(diǎn)。它通過實(shí)時(shí)監(jiān)測PCR反應(yīng)中的熒光信號(hào),能夠提供準(zhǔn)確的定量數(shù)據(jù),廣泛應(yīng)用于基因表達(dá)、病毒檢測、基因突變分析等多個(gè)領(lǐng)域。隨著生物技術(shù)的不斷發(fā)展,ViiA 7的應(yīng)用前景將越來越廣泛,成為科研和臨床實(shí)驗(yàn)中的重要工具。
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