Illumina NextSeq™ 1000 和 NextSeq 2000 測序系統(tǒng)
Illumina NextSeq? 1000 和 NextSeq 2000 測序系統(tǒng)是 Illumina 公司推出的高性能臺式測序平臺,適用于多種基因組學(xué)應(yīng)用。以下是它們的詳細介紹:
共同特點
先進的測序化學(xué)技術(shù):兩者均采用 XLEAP-SBS? 測序化學(xué)技術(shù),這是一種基于 Illumina 標(biāo)準(zhǔn) SBS 化學(xué)的升級版,具有更快的反應(yīng)速度、更高的數(shù)據(jù)質(zhì)量和更強的穩(wěn)定性。XLEAP-SBS 核苷酸使用先進的染料和新型連接物及阻斷物,耐熱性更強,水解減少 50 倍,阻斷物去除速度加快 2.5 倍,減少了相位和預(yù)相位問題。XLEAP-SBS 聚合酶經(jīng)過工程改造,能夠更快且更準(zhǔn)確地整合核苷酸。
高通量和靈活性:NextSeq 1000 和 NextSeq 2000 系統(tǒng)通過光學(xué)系統(tǒng)、儀器設(shè)計和試劑化學(xué)的改進,實現(xiàn)了測序反應(yīng)體積的微型化,同時提高了產(chǎn)出并降低了運行成本。它們提供多種流動槽類型和試劑盒配置,支持不同讀長(從 1×50 bp 到 2×300 bp),能夠滿足從 10 Gb 到 540 Gb 的不同數(shù)據(jù)產(chǎn)出需求,適用于多種應(yīng)用,包括單細胞測序、空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)、宏基因組學(xué)等。
簡化的工作流程:這些系統(tǒng)配備了集成的試劑盒,包含流體和廢液容器,簡化了文庫上樣和測序操作。用戶只需解凍試劑盒,將流動槽插入試劑盒,加入文庫,然后將組裝好的試劑盒插入儀器即可。此外,儀器內(nèi)置 DRAGEN? Bio-IT 平臺,可進行快速的二級分析,生成 FASTq 文件,并支持機載、本地和云端的數(shù)據(jù)分析
高質(zhì)量數(shù)據(jù):NextSeq 1000 和 NextSeq 2000 系統(tǒng)能夠生成高質(zhì)量的數(shù)據(jù),其中 90% 以上的堿基質(zhì)量分數(shù)高于 Q30
不同點
特性 | NextSeq 1000 | NextSeq 2000 |
---|---|---|
流動槽類型 | P1、P2 | P1、P2、P3、P4 |
最大數(shù)據(jù)產(chǎn)出 | 240 Gb | 540 Gb |
讀長支持 | 1×50 bp、2×50 bp、2×100 bp、2×150 bp、2×300 bp | 1×50 bp、2×50 bp、2×100 bp、2×150 bp、2×300 bp |
應(yīng)用場景 | 適用于中等通量需求的研究,如轉(zhuǎn)錄組學(xué)、靶向測序等 | 適用于高通量需求的研究,如全基因組測序、單細胞測序等 |
總結(jié)
NextSeq 1000 和 NextSeq 2000 測序系統(tǒng)均提供了強大的測序能力和靈活的應(yīng)用范圍。NextSeq 1000 更適合中等通量需求的實驗室,而 NextSeq 2000 則提供了更高的通量和更大的擴展性,能夠滿足更復(fù)雜和大規(guī)模的研究需求。
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