SiR-微管蛋白基于硅羅丹明(SiR)熒光團(tuán)和微管結(jié)合藥物多西他賽。SiR-微管蛋白能夠以高特異性和低背景在活細(xì)胞中標(biāo)記微管(1)。SiR-微管蛋白的關(guān)鍵特性包括:i)遠(yuǎn)紅光吸收和發(fā)射波長;ii)細(xì)胞通透性;iii)熒光生成特性;iv)與超分辨率顯微鏡(STED和SIM)的兼容性。這些特性在一個探針中的d特組合使SiR-微管蛋白處于優(yōu)質(zhì)前沿。
艾美捷SiR-微管蛋白試劑盒(#CY-SC002)物理特性:
吸收波長(λabs):652 nm
發(fā)射波長(λem):674 nm
652 nm處的摩爾吸光系數(shù)(ε):1.0×10? mol?1·cm?1
分子量(MW):1303.6 g/mol
分子式(MF):C73H86N4O16S
儲存與操作:
收到后將化合物儲存于-20°C以下。使用無水DMSO配制化合物溶液。使用后將化合物溶液儲存于-20°C以下。在打開前,應(yīng)將小瓶恢復(fù)至室溫。如果儲存得當(dāng),化合物應(yīng)可在數(shù)月內(nèi)保持穩(wěn)定。注意:DMSO溶液應(yīng)特別小心處理,因為DMSO已知會促進(jìn)有機(jī)分子進(jìn)入組織。請按照所有相關(guān)的當(dāng)?shù)匾?guī)定處理這些試劑。
標(biāo)記協(xié)議:
注意:本協(xié)議是使用貼壁于蓋玻片的人類成纖維細(xì)胞優(yōu)化的,并已在其他常見細(xì)胞系中得到驗證。實驗協(xié)議的建議應(yīng)作為起點,每種細(xì)胞類型的優(yōu)標(biāo)記條件應(yīng)通過實驗確定。SiR-微管蛋白基于微管穩(wěn)定藥物多西他賽,因此可以改變活細(xì)胞中微管的動態(tài)。盡管間期細(xì)胞受探針影響較小,但在培養(yǎng)的HeLa細(xì)胞中,超過100 nM的SiR-微管蛋白濃度會導(dǎo)致有絲分裂期延長(1)。如果計劃進(jìn)行長期成像實驗且微管動態(tài)至關(guān)重要,建議將SiR-微管蛋白的濃度保持在100 nM或以下。對于其他用途,建議使用1 µM的SiR-微管蛋白進(jìn)行染色。
1. 配制1 mM儲備液:將SiR-微管蛋白小瓶的內(nèi)容物溶解在50 µL無水DMSO中,制備1 mM儲備液。該溶液應(yīng)儲存于-20°C或更低溫度。不要將溶液分裝成小份,因為它們會更快降解,且該化合物不會因多次凍融循環(huán)而改變。如果儲存得當(dāng),該儲備液應(yīng)可在三個月或更長時間內(nèi)保持穩(wěn)定。如果需要準(zhǔn)確測定儲備液的濃度,可將1 µL 1 mM儲備液稀釋在99 µL含有0.2% SDS的PBS中。在室溫下靜置15分鐘后,在652 nm處測量吸光度。使用上述給定的消光系數(shù)計算濃度。
2. 配制染色液:在細(xì)胞培養(yǎng)基(例如DMEM + 10%胎牛血清)中將SiR-微管蛋白稀釋至所需濃度,并短暫渦旋。由于染色效率可能因細(xì)胞系而異,建議s次嘗試時使用1 µM濃度以快速獲得強(qiáng)染色效果,然后在后續(xù)實驗中降低SiR-微管蛋白濃度,直至獲得最佳染色效果(參見下表中的標(biāo)記濃度和孵育時間)。某些細(xì)胞系可能表達(dá)高水平的外排泵,因此SiR-微管蛋白染色效果較差。在染色液中加入10 µM維拉帕米(一種廣譜外排泵抑制劑)通??梢燥@著改善染色效果。
3. 細(xì)胞準(zhǔn)備和染色:按照常規(guī)方法在蓋玻片、玻璃底培養(yǎng)皿或玻璃底多孔板上培養(yǎng)細(xì)胞。當(dāng)細(xì)胞達(dá)到所需密度時,用染色液替換培養(yǎng)基,確保所有細(xì)胞都被溶液覆蓋。將細(xì)胞置于37°C、含5% CO?的濕潤環(huán)境中孵育,并根據(jù)標(biāo)記時間作為探針濃度的函數(shù)。
*標(biāo)記時間是針對人類成纖維細(xì)胞確定的,可能會因使用的細(xì)胞系而有所不同。
重要提示:SiR-微管蛋白不能染色用甲醛(PFA)和甲醇固定的細(xì)胞,因為這些固定方法會改變微管上探針的結(jié)合位點。
細(xì)胞成像:使用標(biāo)準(zhǔn)Cy5設(shè)置對SiR-微管蛋白進(jìn)行成像效果佳。標(biāo)記后,活細(xì)胞可以立即成像,無需洗滌步驟??蛇x地,用不含探針的新鮮培養(yǎng)基替換一次標(biāo)記液通??梢蕴岣咝旁氡?。如果進(jìn)行時間序列成像,建議在整個實驗過程中將探針濃度保持在100 nM或以下,以獲得穩(wěn)定的信號并避免探針干擾微管動態(tài)(延長有絲分裂期和降低細(xì)胞增殖)。如果在成像前對細(xì)胞進(jìn)行了洗滌,染色效果將持續(xù)數(shù)小時。
文獻(xiàn)參考:
1. Fluorogenic probes for live-cell imaging of the cytoskeleton, G. Lukinavi?ius et al., Nature Methods, 11, 731–733 (2014)
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