Cosmo Bio PUREfrex®系列無細(xì)胞蛋白合成試劑盒原理及特點
PUREfrex®是一系列重組無細(xì)胞蛋白質(zhì)合成試劑,重組系統(tǒng)只與轉(zhuǎn)錄、翻譯相關(guān)因素有關(guān),使用者可以根據(jù)需要來自由調(diào)整反應(yīng)混合物的成分,由于它只含有已知的蛋白質(zhì)和底物,因此在下游應(yīng)用中不必考慮高背景的影響。
什么是PURE?
PURE(Protein synthesis Using Recombinant Elements)系統(tǒng)技術(shù)是由東京大學(xué)的Takuya Ueda教授發(fā)明的重組無細(xì)胞蛋白質(zhì)合成系統(tǒng)。
該反應(yīng)系統(tǒng)僅由蛋白質(zhì)、核糖體、氨基酸和NTPs組成。這些蛋白質(zhì)是轉(zhuǎn)錄、翻譯、氨?;湍芰吭偕匦璧?。所有的蛋白因子和核糖體都是單獨高度純化的,并在緩沖液中與底物如氨基酸、NTPs和tRNAs組裝。翻譯因子包括: 起始因子IF1/IF2/IF3,延伸因子EF-Tu/EF-Ts/EF-G,釋放因子RF1/RF2/RF3,核糖體再循環(huán)因子(RRF),20種氨酰tRNA合成酶(ARS),甲硫氨酰tRNA轉(zhuǎn)移酶。
圖1. PURE(Protein synthesis Using Recombinant Elements)系統(tǒng)技術(shù)示意圖
該系統(tǒng)是僅由轉(zhuǎn)錄和翻譯系統(tǒng)組成的,不像其他使用細(xì)胞裂解物的無細(xì)胞蛋白質(zhì)合成系統(tǒng)。該系統(tǒng)沒有未知蛋白質(zhì),成分可以隨客戶需要調(diào)整。
什么是PUREfrex?
PUREfrex是基于PURE系統(tǒng)技術(shù)的產(chǎn)品,該試劑盒主要由3種試劑組成。溶液I包含氨基酸、NTPs、其他小分子化合物和tRNAs。溶液II包含RNA聚合酶、翻譯因子和其他蛋白質(zhì)。溶液III含有純化的核糖體。將純化的組分以達(dá)到最大蛋白質(zhì)合成活性的濃度混合。對于蛋白質(zhì)合成,將編碼自己感興趣的蛋白質(zhì)的DNA(或mRNA)加入到溶液I、II和III的混合物中,然后孵育反應(yīng)混合物。PUREfrex減少了與蛋白質(zhì)合成無關(guān)的污染物。例如,來自大腸桿菌的脂多糖減少到每ul反應(yīng)混合物約0.1 EU。核糖核酸酶、β-半乳糖苷酶和其他污染蛋白的量也減少了。PUREfrex試劑中包含的所有翻譯因子和其他蛋白質(zhì)不包含任何標(biāo)簽序列。這使得可以使用任何標(biāo)簽序列來純化和檢測合成的蛋白質(zhì)。
圖2. PUREfrex與原始PURE系統(tǒng)中污染物比較
PUREfrex®試劑盒總共有3個系列:PUREfrex®1.0;PUREfrex®2.0;PUREfrex®2.1。
PUREfrex®1.0
2011年推出,反應(yīng)溶液的成分信息是公開的,適用于產(chǎn)品定制等需要明確組成成分信息的研究。雖然使用 PUREfrex® 2.0 合成蛋白時的速度較快,但可能無法及時形成和折疊二硫鍵等導(dǎo)致不溶,此時使用合成速度較慢的PUREfrex® 1.0 效果可能更好。
PUREfrex®2.0
2015年推出,PUREfrex® 2.0改進了從大腸桿菌中純化的所有組分的制備方法,并優(yōu)化了因子的組成,使PUREfrex 2.0實現(xiàn)了比PUREfrex 1.0高2-10倍的蛋白質(zhì)生產(chǎn)率。適用于需要合成大量蛋白及多種蛋白的研究。反應(yīng)液成分信息保密。
PUREfrex®2.1
于2017年推出,在保留PUREfrex® 2.0 反應(yīng)液組成的基礎(chǔ)上,單獨添加了還原劑,因此可根據(jù)添加的還原劑(和氧化劑)種類和數(shù)量來調(diào)整合成過程中的氧化還原狀態(tài)。適用于需嚴(yán)格控制氧化還原狀態(tài)的含二硫鍵結(jié)合的蛋白合成。
圖3.PUREfrex® 1.0和PUREfrex® 2.0對比數(shù)據(jù)
圖4.PUREfrex®2.0和PUREfrex®2.1成分對比
產(chǎn)品信息
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品貨號 | 規(guī)格 |
PUREfrex® 1.0 | GFK-PF001-0.25-EX | 1 x 250 µl |
GFK-PF001-2ML-EX | 2 ml | |
GFK-PF001-10ML-EX | 5 x 2 ml | |
PUREfrex® 2.0 | GFK-PF201-0.25-EX | 1 x 250 µl |
GFK-PF201-2ML-EX | 2 ml | |
GFK-PF201-10ML-EX | 5 x 2 ml | |
PUREfrex® 2.1 | GFK-PF213-0.25-EX | 1 x 250 µl |
GFK-PF213-2ML-EX | 2 ml | |
GFK-PF213-10ML-EX | 5 x 2 ml |
應(yīng)用
使用PUREfrex®可合成各種活性蛋白,包括原核蛋白、真核蛋白、膜蛋白、含二硫鍵的蛋白質(zhì)、含非天然氨基酸的蛋白質(zhì)。PUREfrex®可用于以下研究領(lǐng)域,適用于各種蛋白質(zhì)的小規(guī)模、高通量合成,也是蛋白質(zhì)功能評估的機器學(xué)習(xí)平臺的理想選擇。
1. 核糖體展示技術(shù)
2. mRNA展示技術(shù)
3. 蛋白翻譯機制研究
4. 蛋白質(zhì)合成后的折疊
蛋白合成添加劑
根據(jù)您的蛋白質(zhì)的性質(zhì),可以選擇不同的添加劑,添加到PUREfrex®試劑盒中,改善蛋白的折疊和溶解性。
1.分子伴侶
分子伴侶像hsp70(如E. coli DnaK)有助于合成蛋白質(zhì)的正確折疊。由于PUREfrex®試劑盒不含任何分子伴侶,一些蛋白質(zhì)可能難以形成正確的構(gòu)象,合成后為不溶性。在這種情況下,添加分子伴侶可能有助于增加溶解性和活性。
產(chǎn)品貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 描述 |
GFK-PF003-0.5-EX | DnaK Mix | 500 µl Equivalents | 高度純化的大腸桿菌來源的DnaK、DnaJ、GrpE蛋白以適當(dāng)?shù)臐舛缺壤A(yù)混后的溶液 |
GFK-PF003-10ML-EX | DnaK Mix | 5 x 2 ml Equivalents | |
GFK-PF004-0.5-EX | GroE Mix | 500 µl Equivalents | 經(jīng)高度純化的大腸桿菌來源的GroEL、GroES蛋白以適當(dāng)?shù)臐舛缺壤A(yù)混后的溶液 |
GFK-PF004-10ML-EX | GroE Mix | 5 x 2 ml Equivalents |
2.形成二硫鍵
對于某些蛋白質(zhì),如分泌蛋白,二硫鍵的形成對其穩(wěn)定性或活性很重要。二硫鍵通常是由相鄰半胱氨酸殘基的巰基(SH-)氧化形成的。因此,氧化環(huán)境是形成二硫鍵所必需的。此外,二硫鍵異構(gòu)酶(如E. coli DsbC)可以催化二硫鍵交換,也是形成半胱氨酸正確配對所必需的。
產(chǎn)品貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 描述 |
GFK-PF005-0.5-EX | DsbC Set | 500 µl Equivalents | 含有作為氧化谷胱甘肽(GSSG)和二硫鍵異構(gòu)酶的大腸桿菌 DsbC |
GFK-PF005-10ML-EX | DsbC Set | 5 x 2 ml Equivalents | |
GFK-PF006-0.5-EX | PDI Set | 500 µl Equivalents | 含有氧化谷胱甘肽(GSSG)、人源二硫鍵異構(gòu)酶(PDI)和PDI的氧化酶Ero1α |
GFK-PF006-10ML-EX | PDI Set | 5 x 2 ml Equivalents |
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