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干貨 | 限制性內(nèi)切酶知多少?

2022-1-7  閱讀(1656)

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何謂限制性內(nèi)切酶?



限制性內(nèi)切酶是一種能夠識(shí)別雙鏈DNA分子中特定核苷酸序列,并在特定位置切割DNA鏈中的磷酸二酯鍵的一類酶,簡(jiǎn)稱限制酶。


不同的限制性內(nèi)切酶會(huì)識(shí)別不同的DNA序列,它可以在識(shí)別序列內(nèi)或距識(shí)別序列不遠(yuǎn)的位置處切割DNA,酶切之后會(huì)形成不同類型的產(chǎn)物,如下圖中的BamHI形成5’粘性末端產(chǎn)物,KpnI形成3’粘性末端產(chǎn)物,EcoRV形成平末端產(chǎn)物。



▲ BamHI、KpnI、EcoRV酶切示意圖



限制性內(nèi)切酶于分子克隆實(shí)驗(yàn)中。但除了克隆,它還可以應(yīng)用于疫苗研發(fā)生產(chǎn)、基因測(cè)序、SNP鑒定、ddPCR等領(lǐng)域。




限制性內(nèi)切酶的命名規(guī)則


限制性內(nèi)切酶的命名主要是根據(jù)細(xì)菌的屬名、種名、菌株或血清型、發(fā)現(xiàn)的順序而定,以BstEII為例,命名規(guī)則如下表所示:
表1:限制性內(nèi)切酶的命名規(guī)則

縮寫

全名

含義

B

Bacillus

屬名第一個(gè)字母

st

stearothermophilus

種名前兩個(gè)字母

E

ET

株系名第一個(gè)字母

II

第二個(gè)發(fā)現(xiàn)

在此類細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)的順序





限制性內(nèi)切酶的分類




根據(jù)結(jié)構(gòu)的復(fù)雜程度、作用方式與輔因子的區(qū)別,限制性內(nèi)切酶可分為四大類,以下內(nèi)容總結(jié)了各類的特點(diǎn)和典型酶種:



1

Type Ⅰ

特點(diǎn)

1.同時(shí)具有識(shí)別切割和修飾活性;
2.能夠識(shí)別DNA特定序列,切割位點(diǎn)距離識(shí)別位點(diǎn)不定,可達(dá)數(shù)千個(gè)堿基之遠(yuǎn);
3.作用時(shí)需要ATP。

典型酶種:EcoB、Ecok等

2

Type Ⅱ

特點(diǎn)

1.只具有識(shí)別切割的作用;
2.識(shí)別序列多為短的回文序列(一般為4-8bp),酶切位點(diǎn)通常就是所識(shí)別序列,特異性切割;
3.作用時(shí)需要Mg
2+;
4.分子克隆中的一類限制酶。

典型酶種:HindII、NotI等

3

Type Ⅲ

特點(diǎn)

1.同時(shí)具有識(shí)別切割和修飾活性;
2.切割位點(diǎn)大約距離識(shí)別位點(diǎn)24-26bp;
3.作用時(shí)需要ATP。

典型酶種:Hinflll等

4

Type Ⅳ

特點(diǎn)

1.僅切割被甲基化修飾了的DNA序列;
2.切割位點(diǎn)距離識(shí)別位點(diǎn) 30 bp左右。

典型酶種:MrcA、McrBC等

除了以上分類,根據(jù)識(shí)別和切割位點(diǎn)的異同可以分為3類,如下表所示:

表2:同裂酶、異列酶和同尾酶對(duì)比


內(nèi)切酶類別

特點(diǎn)

典型酶種

Type I

1、同時(shí)具有識(shí)別切割和修飾活性;

2、能夠識(shí)別DNA特定序列,切割位點(diǎn)距離識(shí)別位點(diǎn)不定,可達(dá)數(shù)千個(gè)堿基之遠(yuǎn);

3、作用時(shí)需要ATP。

EcoB、EcoK等

Type II

1、只具有識(shí)別切割的作用;

2、識(shí)別序列多為短的回文序列(一般為4-8bp),酶切位點(diǎn)通常就是所識(shí)別序列,特異性切割;

3、作用時(shí)需要Mg2+

4、分子克隆中的一類限制酶。

HindIII,NotI等

Type III

1、同時(shí)具有識(shí)別切割和修飾活性;

2、切割位點(diǎn)大約距離識(shí)別位點(diǎn)24-26bp;

3、作用時(shí)需要ATP。

HinfIII等

Type IV

1、僅切割被甲基化修飾了的DNA序列;

2、切割位點(diǎn)大約距離識(shí)別位點(diǎn) 30 bp左右。

McrA,McrBC等



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