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    識破支原體污染,拯救你的細(xì)胞支原體(mycoplasma)是一種沒有細(xì)胞壁的小原核細(xì)胞。在細(xì)胞培養(yǎng)過程中,支原體污染率達(dá)到60%以上,當(dāng)細(xì)胞(特別是傳代細(xì)胞)被支原體污染后,細(xì)胞內(nèi)的DNA、RNA及蛋白表達(dá)發(fā)生改變,污染嚴(yán)重時細(xì)胞生長緩慢,細(xì)胞形態(tài)發(fā)生改變,并出現(xiàn)細(xì)胞病變。因而細(xì)胞培養(yǎng)過程中,防止支原體污染是一個世界性的難題。圖1支原體污染細(xì)胞后,細(xì)胞形態(tài)發(fā)生改變(來源:該圖片來源于網(wǎng)絡(luò))支原體污染細(xì)胞后很難察覺,同時若細(xì)胞培養(yǎng)過程受到了支原體污染,*清除支原體也是非常困難的。因此在細(xì)胞培養(yǎng)過程
  • FFPE樣本建庫,你需要的修復(fù)試劑在這里

    FFPE樣本是什么?做病理的小伙伴對FFPE樣本肯定不陌生,F(xiàn)FPE(Formalin-FixedandParrffinEmbedded)樣本是福爾馬林固定石蠟包埋的樣本,固定包埋的方法能夠使組織在常溫保存很長時間。早FFPE樣本主要是用于病理形態(tài)學(xué)觀察,近些年,隨著精////準(zhǔn)醫(yī)療的滲透發(fā)展,F(xiàn)FPE樣本在臨床病理檢驗、腫瘤基因檢測中也得到廣泛使用。圖1FFPE樣本人們將FFPE樣本中的核酸提取出來進(jìn)行建庫,然后利用高通量測序技術(shù)對FFPE樣本的核酸進(jìn)行測序和分析,就能得到病理和腫瘤相關(guān)的很多
  • 準(zhǔn)備一份好的核酸模板,真的非常有必要

    “開弓沒有回頭箭”,核酸質(zhì)量是分子實驗成功的基礎(chǔ)核酸提取是實驗室蕞常見實驗,我們經(jīng)常會抽提基因組或者總RNA,少則幾份,多則上百份。準(zhǔn)備提取材料,加入TRIzol或裂解液,加入氯////仿、異丙醇,純化柱或手提進(jìn)行核酸沉淀和洗滌、洗脫,半小時后就可以得到核酸樣本。因為提取實驗太平常,以至于我們從來沒有思考過這個實驗背后的問題。大家通常測濃度、測比值,而教科書中已明確告知我們測出來數(shù)值(純粹核酸的比值范圍是固定的)代表了核酸品質(zhì),但偏離標(biāo)準(zhǔn)范圍的數(shù)值往往被忽視,對實驗結(jié)果的影響往往得不到很好的解釋
  • 基因測序的這些年

    基因測序的這些年P(guān)art1測序平臺的發(fā)展歷程1865年,Sanger提出的雙脫氧末端終止測序法后對于基因序列測定方法具有極///大的推動作用。隨后為了彌補(bǔ)一代測序通量低的缺點,通量更高的二代測序技術(shù)以及讀長更長的三代測序技術(shù)迅速發(fā)展起來。在此小翊為大家整理了從一代到三代測序平臺以及有代表性測序儀器的發(fā)展歷程。圖1測序平臺的發(fā)展歷程Part2二代測試的風(fēng)華年代各大公司對于二代測序市場的競爭史相當(dāng)激烈的,目前在市場中占有穩(wěn)固地位的主要是Illumina、MGI(華大智造)以及LifeTechnolo
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    美國所謂的“凈網(wǎng)計劃”,IVD行業(yè)會不會是下一個目標(biāo)?IVD,即體外診斷,是醫(yī)療器械的第—大市場,它主要分為4大賽道:生化診斷、免疫診斷、分子診斷、POCT。其中分子診斷被稱為IVD的黃金賽道,分子診斷技術(shù)的迭代創(chuàng)新,催化了行業(yè)格局日新月異的變化。近些年來,分子診斷方興未艾,其中二代高通量測序(NGS)一騎領(lǐng)///先,憑借不斷增加的檢測通量和日益降低的檢測成本,帶動了臨床應(yīng)用的突破,大大推動了分子診斷在遺傳病、病原體、癌基因檢測等領(lǐng)域的蓬勃發(fā)展。在腫瘤領(lǐng)域,頭部公司燃石醫(yī)學(xué)、泛生子于今年6月先后
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    PCR-Free建庫,你get到了嗎?高通量測序中,常規(guī)的文庫構(gòu)建需要PCR擴(kuò)增,一方面,是為了對微量DNA樣本進(jìn)行擴(kuò)增,提高文庫產(chǎn)量,另一方面,可以放大熒光信號,讓測序儀更容易捕獲和識別熒光信號,提高測序準(zhǔn)確度。但是,PCR就像一把“劍”,在解決了樣本起始量低的問題并起到放大熒光信號作用的同時,卻也引入了擴(kuò)增錯誤和偏向性,不能地呈現(xiàn)基因組序列“真實面貌”。因此,PCR-Free技術(shù)的引入,既具備了PCR的優(yōu)勢,也克服了PCR的缺點。什么是PCR-Free技術(shù)?常規(guī)NGS文庫構(gòu)建的核心步驟為:基
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